使用了DeePMD-kit软件包来训练深度势能模型,并将其应用于分子动力学模拟。 采用了CP2K软件包进行密度泛函理论(DFT)计算,使用M06-2X泛函和QZV3P基组来准备训练数据集。 在LAMMPS软件中运行DPMD模拟,以研究水自离解和离子在界面处的分布。 运用了PLUMED插件将外部偏置势能V(s)纳入DPMD模拟的系统势能中,以实现增强采样。
2. 可能你的体系比较大，我推荐用CP2K或者ABACUS。（具体问题具体分析，但是无论是用什么软件算，都要...
图四,DPMD模拟SiO2和CeO2的Au128+Au32+Au32团簇,采用CP2k程序产生数据集,DeePMD-kit+DPGEN做循环采样训练,Lammps做最终的采样模拟。发现Au在不同的氧化物表面的接触角显著不同,在SiO2上的接触角度为140度,在CeO2上接触角为70度,并且Au原子在SiO2上的迁移速率要远快于在CeO2表面,尤其是CeO2的台阶位置。 图...