最近在调研机器学习势方向的内容,然后用DeePMD-kit和DP-GEN做了一些尝试,但因为组内服务器不连外网,所以用的DP-GEN版本比较旧,并且开发团队也不发布DP-GEN的离线版本(截止v.10.6),所以只能进行离线安装最新版本。由于我刚刚涉及计算化学这个方向,对服务器的使用也比较生疏,所以安装过程也很痛苦,但也确实学到了不少...
而在所有任务中,都通过同一固定次序的三元素 type_map 列表,如:["A", "B","C"],将各元素映射到一个固定的 deepmd 格式序号上,如单质时:0,1,2,二元:[0,1],[1,2],[0,2];三元:[0,1,2],从而使 DeePMD-kit 能够根据这一对应关系,正确地将性质数据地映射到相应的元素上。
DP-GEN(Deep Generator)是一款用 Python 编写的软件,可生成基于深度学习的原子间势能和力场模型。DP-GEN 依赖于DeepMD-kit,通过与VASP、CP2K等分子模拟软件的高度可扩展接口,DP-GEN 能够自动生成脚本并在高性能集群上维护作业队列和分析结果。 DP-GEN 目前支持 HPC 系统(Slurm、PBS、L...
DeePMD-kit和DP-Gen安装啦啦黑还黑 立即播放 打开App,流畅又高清100+个相关视频 更多 1.3万 15 56:14 App DP-GEN machine.json输入文件配置 10.3万 35 01:37 App 将军:我看DeepSeek是相思了 120.7万 808 01:53 百万播放 App 当我问Deepseek要核弹发射密码,结果... 1.1万 2 31:54 App GPU超算上...
DP-GEN currently supports for HPC systems (Slurm, PBS, LSF and cloud machines ), Deep Potential interface with DeePMD-kit, MD interface with LAMMPS, Gromacs and ab-initio calculation interface with VASP, PWSCF, CP2K, SIESTA and Gaussian, Abacus, PWMAT, etc . We're sincerely welcome and ...
DP-GEN(Deep Generator)是一款用 Python 编写的软件,可生成基于深度学习的原子间势能和力场模型。DP-GEN 依赖于DeepMD-kit,通过与VASP、CP2K等分子模拟软件的高度可扩展接口,DP-GEN 能够自动生成脚本并在高性能集群上维护作业队列和分析结果。 DP-GEN 目前支持 HPC 系统(Slurm、PBS、LSF 和云端机器),DeePMD-kit...
一、安装DeepMD-kit安装Anaconda，可通过下载并执行相应脚本来完成。使用conda命令安装deepmd-kit v2.0.0，注意根据GPU型号选择合适的CUDA Toolkit版本（本文中选择10.1），并确保NVIDIA驱动版本较高，避免因版本不一致导致的错误。二、使用DeepMD-kit先安装dpdata。使用`script.py`脚本（源自dpdata的GitHub...
DeePMD-kit就是一个实现好了的、开源的神经网络势(高维神经网络称为深度学习)的训练,使用工具。DP-GEN 也是他们开发的一个主动学习进行构象采样的工具,可以减少训练集中的冗余度,从而减少了DFT的需求。通过训练一组神经网络模型分别跑神经网络势动力学(DeepMD),再用DFT评估几组模型中误差较大的点,可以主动探索未知...
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一、DP-GEN简介 DP-GEN（Deep Generator）是一款用 Python 编写的软件，可生成基于深度学习的原子间势能和力场模型。DP-GEN 依赖于DeepMD-kit，通过与VASP、CP2K等分子模拟软件的高度可扩展接口，DP-GEN 能够自动生成脚本并在高性能集群上维护作业队列和分析结果。DP-GEN 目前支持 HPC 系统（Slurm、PBS...