DoubletFinder去双胞根据不同矩阵质量耗时长短差异很大,所以很多样本的建议多个任务并行跑,不然要等很久很久很久(亲测)。有时候用DoubletFinder也不能完全去掉所有双胞,但是双胞一般会自动聚成一个亚群,可以手动删除这种亚群。
我们一般拿到单细胞矩阵需要做的一个预处理步骤是去双胞，而常用的一个R包是 DoubletFinder ，详细教程可查阅其GitHub主页，本文主要展示如何使用这个包，以及批量化处理的脚本示例。因为实际分析情况中会有多个矩阵需要单独去除双胞，样本多起来就比较麻烦，因此封装成函数是一个办法。这篇文章会详细展示...