# install.packages("devtools") # or # devtools::install_github("Simon-Leonard/FlexDotPl library(FlexDotPlot) 加载数据 FlexDotPlot 包采用数据框作为输入:前两列包含沿 x 和 y 轴分布的两个因子,后跟要显示的相应定量和/或定性数据: 用户可以指定在 doplot 上显示哪个因素以及每个因素应如何显示: 加载...
以前老赵分享过Dotplot的美化代码, 今天偶然间在github检索到某文章作者分享的一个R代码, 里头的Dotplot感觉还不错, 果断保存来复现。 library(ggpubr) library(ggimage) library(ggplot2) library(Seurat) lib…
比如咱们生信菜鸟团的Dotplot美化——使用ggplot2基于结果美化 生信益站的Seurat::DotPlot美化 (二) ——细胞亚群坐标轴Color Bar注释 那这边小谢就偷个懒,基于前辈们整理好的代码来使用ggplot2绘制marker基因的点图。 1. 提取数据并整理细胞亚群排序 #获取需要的数据 p <- DotPlot(pbmc, features = split(top5...
(df.plot$id)),labels = levels(df.plot$id),sec.axis = dup_axis())+ #复制 y轴 代替边框效果 facet_grid(~label, scales="free_x",space = "free")+theme_classic() + theme( axis.text.x = element_text(size=12, angle=0, hjust=0.5, color="black",face="bold"),#x轴标签样式 axis...
生信益站的Seurat::DotPlot美化 (二) ——细胞亚群坐标轴Color Bar注释 那这边小谢就偷个懒,基于前辈们整理好的代码来使用ggplot2绘制marker基因的点图。 1. 提取数据并整理细胞亚群排序 #获取需要的数据 p <- DotPlot(pbmc, features = split(top5$gene, top5$cluster), ...