DNAMAN提供用于序列搜索和比较的工具，包括核苷酸或氨基酸序列、共有序列、开放阅读框、重复序列。小干扰 RNA (siRNA) 选择工具可用于提高siRNA 设计的质量。用户可以在DNAMAN程序中对 NCBI 数据库或其他基于网络的序列服务器执行BLAST搜索。限制分析 DNAMAN为DNA序列的限制性分析提供直观的界面。结果可以显示为文本、限...
01软件安装 软件解压后,先点击Setup.exe安装原版,安装完成先不要运行DNAMAN;复制DNAMAN.exe 到安装目录下(默认目录为C:\Program Files (x86)\DNAMAN\),替换同名文件即可。 02 常用功能 还是先看一下DNAMAN的初始界面,从上到下分别是: 主菜单:文件,编辑,查找,酶切位点,引物等; 工具栏:新建,打开,打印,复制...
Alignment method比对方法,通常可选Quick(快速比对)或Smith&Waterman(最佳比对),当选择快速比对时,设置较小的k-tuple值,可以提高精确度,当序列较长时,一般要设置较大的k-tuple值。(dna序列:k-tuple值可选范围2-6;蛋白质序列:k-tuple值可选范围1-3。 (2)多序列同源性分析 通过打开Sequence/Multiple Sequence A...
我已经在我的计算机上安装了 DNAMAN 程序,但我不知道如何使用它。 如果您是初次使用 DNAMAN,您可以按照下述说明进行执行。 1. 要进行序列分析: i.选择“文件”|”打开菜单。 ii. 从 Open 中选择 Example1 文件 “文件”对话框。单击 Open 按钮。
DNAMAN具备用户友好的界面和强大的功能，提供了便捷的DNA分析解决方案。DNAMAN的特点 适应DNA数据的大规模分析和数据处理，具有完整的分子生物学序列编辑、比对、构建进化树、分析统计学等一系列分析软件功能。安装DNAMAN 操作系统要求 DNAMAN支持Windows操作系统（Windows7,8,10等）。软件安装方式 按照DNAMAN提供的安装...
1.打开DNAMAN,点击“Sequence-Alignment-Multiple sequence alignment”,进入比对页面。 2.点击“File”,上传序列文件(fasta格式),选择序列类型,点击“Next”。 3.这一步和下一步默认即可。 4.参数默认即可,点击“Finish”,即可得到比对结果。 5.若需要导出图,点击“Output-Graphic file”,保存EMF格式图片。随后在...
Dnaman是一款由美国LynnonBiosoft公司研发的高度集成化的分子生物学综合应用软件,可用于核酸、蛋白质序列、限制性酶切等分析,是生物学家必备工具之一。今天先给大家简单介绍下利用Dnaman进行多重序列比对分析。 序列载入 打开Dnaman软件,如下图,第一栏为主菜单栏,有12个常...
本文以具体使用DNAMAN的过程为例来说明如何使用DNAMAN。 1.将待分析序列装入Channel (1)通过FileOpen命令打开待分析序列文件,则打开的序列自动装入默认Channel。(初始为channel1)可以通过激活不同的channel(例如:channel5) 来改变序列装入的Channel。 (2)通过Sequence/LoadSequence菜单的子菜单打开文件或将选定的部分序列...
对于DNAMAN这款软件接触较早,但很陌生,因为唯一长期使用的一个功能就是多序列比对,其他功能均为触及。后来了解到有很多软件都可以进行多序列比对后,对于DNAMAN的使用次数就越来越少。于是,这款软件就在电脑的某个角落不知所措。 但是,打开这个软件一看就知道它有很多功能。今天有空,就重新打开这个软件对其涉及的基...