DNA 稳定同位素探测技术 (DNA-SIP) 是一种分子生态学技术,它使用稳定同位素来追踪复杂环境中微生物的基因组 DNA。利用稳定同位素在复杂环境中追踪微生物基因组DNA,可实现研究从单一微生物生理过程向微生物群落生理生态学的转变,在更高、更复杂的层次上定向探索重要的微生物资源,促进微生物生理生态学和生物技术的发展。
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dna-sipdna-sip DNA-SIP(稳定同位素探针)技术是环境微生物研究中被广泛利用的一种分子生物学方法,通过对底物进行稳定同位素标记,来探寻降解或同化底物的环境微生物。等密度梯度离心是DNA分层的关键步骤,基于当前文献中一些常见的离心条件,我们对DNA-SIP所需的离心速度、离心时间与溶液初始密度进行了实验分析。进行超...
美格基因｜DNA-SIP文章分享 本研究以尾矿样品建立微宇宙实验，利用DNA-SIP、扩增子测序和宏基因组测序揭示了微生物介导的硫氧化锑还原耦合的全新生物地球化学过程，确定了微生物Desulfurivibrio spp.参与了此过程及相应代谢途径，为因矿山开采导致的尾矿污染问题提供了强有力的解决手段。Desulfurivibrio spp.介导的硫氧...
稳定性同位素核酸探针技术(DNA-SIP, DNA-based stable isotope probing)是利用稳定同位素如13C或18O等标记微生物DNA,从而把复杂环境中特定生物地球化学等过程和功能微生物类群偶联起来的一种强有力的技术,对复杂环境中关键功能微生物类群示踪和新功能微生物类群发掘具有重要意义,避免大量费时的纯菌株分离工作。
DNA-SIP(基于DNA的序列非依赖性分析)是一种基于高通量测序的方法,用于表征基因组DNA的甲基化状态。它基于这样的原理,可以通过分析限制酶消化模式来推断DNA片段的甲基化状态。 DNA-SIP程序涉及以下步骤: 1.提取基因组DNA并用识别特定DNA序列的限制酶消化。 2.将消化的DNA片段连接到包含条形码序列的接头,该序列可识别...
dna-sip技术原理dna-sip DNA-SIP (Stable Isotope Probing) is a powerful and innovative technique used in environmental microbiology to identify and characterize the functional microbial populations in complex communities. This technique is based on the principle of using stable isotopes to label DNA of...
功能基因为筛选有效鉴定甘蔗//大豆间作系统的稳定性同位素核酸探针技术(DNA-SIP)中超高速离心后15N-DNA富集位置的指示功能基因,利用实时荧光定量PCR技术(qPCR),检测6个氮素循环功能基因在不同浮力密度离心液DNA中的相对丰度分布,通过对氮素循环功能基因相对丰度作图分析,nifH和amoA基因在甘蔗//大豆间作和大豆单作种植模式...
稳定性同位素核酸探针技术DNA-SIP(Stable isotope probing),是将复杂环境中微生物物种组成及其生理功能耦合分析的有力工具.微生物的体积在μm尺度,因此,自然环境中微生物群落在μm尺度下生理过程的发生,发展,其新陈代谢物质在环境中累积与消减的动力学变化规律,形成了微生物生理生态过程,决定了不同尺度下生态系统物质...