Progress in science depends on new ideas, new discoveries, and new techniques, and often the three are interdependent. Nowhere is this more apparent than in the two techniques, DNA sequencing and polymerase chain reaction (PCR), that were born out of creative ideas and rapidly gave rise to ...
扩增完毕后,将不同样品的扩增子片段混合并通过琼脂糖凝胶电泳、割胶回收的方法进行片段纯化。 03 鸟枪法打断 鸟枪测序(Shotgun sequencing)是将大分子的目标DNA随机地处理成大小不同的小片段进行测序,并在后续的生物信息学分析中将这些短序列组装成目标DNA的技术方法。由于测序技术读长的限制,在基因组、宏基因组测序中...
近日,杂志Nature chemistry上发表了一篇题为“Nanopore DNA sequencing technologies and their applications towards single-molecule proteomics”的综述文章。在这篇综述中,作者描述了纳米孔DNA测序的生化创新,并讨论了基于纳米孔的肽测序的技术现状并探索...
靶向测序(Target region sequencing,TS),也称目标区域测序,指利用多重PCR或捕获方法扩增目标基因组区域并测序,可以获得指定目标区域的变异信息。 靶向测序主要有两种形式:基于扩增子建库测序或基于杂交捕获法建库测序。与杂交捕获法建库测序相比,扩增子建库测序所需起始样本少...
膜蛋白在动态纳米环境中表现出显著的多样性和精确的定位。传统的方法受限于有限的蛋白质种类和空间覆盖范围,阻碍了对膜蛋白的全面分析,本文作者开发了一种名为proximity-a ctivated DNA scanning encoded sequencing(PADSE-seq)的方法,可以...
全基因组重亚硫酸盐测序（Whole genome bisulfite sequencing, WGBS/BS-seq）是DNA甲基化研究的金标准。今天就跟着伯小远一起学习一下DNA甲基化以及BS-seq技术是如何运用到植物DNA甲基化研究的吧。1 DNA甲基化的定义 DNA甲基化是指在DNA甲基转移酶的催化下，以S-腺苷甲硫氨酸（S-adenosyl methionine, SAM）为甲基...
② Perform PCR,Amplify the DNA region of interest ③ Generate products,Generate sequencing products by cycle sequencing; purify reactions to remove fluorescent ddNTP. 生成产品,通过循环测序生成测序产品;纯化反应以去除荧光ddNTP。 ④ Run sequence,The products of the sequencing reaction to perform capillary...
Single-MoleculeR-loop Footprinting and sequencing(SMRF-seq)依赖于DNA在非变性条件下,重亚硫酸盐将R环结构中单链DNA未配对的胞嘧啶C转化为尿嘧啶U。经过位点特异性的PCR扩增和文库构建后,从被标记的单链扩增出的DNA序列含胞嘧啶到胸腺嘧啶(T)转换...
全基因组重亚硫酸盐测序(Whole genome bisulfite sequencing, WGBS/BS-seq)是DNA甲基化研究的金标准。今天就跟着伯小远一起学习一下DNA甲基化以及BS-seq技术是如何运用到植物DNA甲基化研究的吧。 1 DNA甲基化的定义 DNA甲基化是指在DNA甲基转移酶的催化下,以S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosyl methionine, SAM)为甲基...
首先,全基因组测序的英文是Whole Genome Sequencing,简称WGS,目前默认指的是人类的全基因组测序。所谓全(Whole),指的就是把物种细胞里面完整的基因组序列从第1个DNA开始一直到最后一个DNA,完完整整地检测出来,并排列好,因此这个技术几乎能够鉴定出基因组上任何类型的突变。对于人类来说,全基因组测序的价值是极大的...