RNA甲基化是指在RNA分子上添加甲基化修饰的过程,通常是在RNA甲基转移酶的催化下将甲基供体中的甲基基团转移至RNA碱基的现象,一般发生在RNA转录后,是一种重要的表观遗传学调控机制,可以影响RNA的稳定性、成熟、转运、翻译和其他功能。 最早发现的RNA甲基化是m6A甲基化,即发生在腺苷酸(A)N6处的m6A甲基化(N6-甲基腺...
近日,北京大学的伊成器团队和牛津大学的宋春啸团队合作在Protein & Cell发表特邀综述“Mapping the epigenetic modifications of DNA and RNA”,该篇综述详细总结了目前高通量DNA/RNA修饰检测技术的方法和发现,包括应用三代测序在单碱基水平鉴定修饰位点,并讨论了该领域存在的问题和今后研究的方向。 DNA修饰在个体发育...
然而,除了遗传密码之外,核酸还蕴藏了另外一层复杂的由化学修饰主导的表观遗传修饰系统来扩展自身信息编码的能力[1]。这些修饰通过调节基因表达网络参与了多种重要的生物学过程,也被叫做表观遗传修饰[2]。表观遗传修饰通常包括DNA、RNA和蛋白质上发生的化学修饰,而我们将DNA和RNA上的化学修饰称之为核酸修饰。核酸修饰...
有意思的是,m⁶A(甲基腺嘌呤)最近被证明是发生在原核及真核DNA中的一种表观遗传修饰(勿与RNA m⁶A修饰混淆),这就意味着一定存在“Writer”(“笔”/添加修饰,甲基化酶)和“Eraser”(“擦子”/消除修饰,去甲基化酶)。 如果参照DNA m⁵C和RNA m⁶A的去甲基化的逻辑,那就是渐次将甲基氧化再脱去。
赵存友团队及合作者在Molecular Psychiatry还发表了题为LncRNA-AC006129.1 reactivates a SOCS3-mediated anti-inflammatory response through DNA methylation-mediated CIC downregulation in schizophrenia【7】的研究论文,发现了一个新的长链非编码RNA(LncRNA-AC006129.1)作为炎症反应调节因子,通过表观遗传学修饰调控抗炎...
表观遗传基因调控作用在DNA和组蛋白N末端,对基因表达稳定性起着关键性作用。染色质是由真核生物细胞核内的DNA和蛋白质组成,根据致密程度的不同可分为常染色质(euchromatin)和异染色质(heterochromatin)。基因组表观修饰的主要机制可分为DNA中的甲基化和染色质中组蛋白的转录后修饰,DNA的CpG二核苷酸和组蛋白H3赖氨酸...
前期研究表明,表观遗传修饰(DNA甲基化、组蛋白修饰、小RNA、转座子及染色质重塑等)影响植株再生。DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰形式,它通过不改变DNA的一级结构而调控组织特异性基因表达和维持基因组的稳定性。现有的研究多集中在植株再生过程中总基因组DNA甲基化水平的改变,然而,对于单基因甲基化如何调控基因...
通过RNA-seq分析（图2），遗传分析以及H3K27me3的ChIP-seq（图3）分析发现，RPA2A和PRC2具有相同的靶基因，包括关键的开花调节基因FT、AG和AGL71。此外，RPA2A与PRC2的组分CLF、EMF2、MSI1存在物理互作，能招募CLF至FT、AG和AGL71的染色质上。总之，复制蛋白RPA2A通过物理互作招募PRC2到关键的开花调节基因，...
2). DNA甲基化位点主要从基因调控表达层面发挥作用, 联合普通转录组测序(polyA富集protein_coding gene并进行建库分析)结果可以发现: 甲基化调控区域, 力证甲基化调控结果(这也是目前很多公司的关联分析切入口); 3). 但是, 细胞中的转录调控影响因子太多, DNA甲基化仅仅是基因沉默与否的切入口, 关于lncRNA对protein...