RNA聚合酶I、II和III的发现开辟了基因表达的新时代。在这篇文章中,James结合自己实验室的发展,回忆了DNA模板在RNA聚合酶II转录过程中发生了由裸露到染色质结合的转变这一发现的历史过程,强调了这些研究揭示了转录因子与染色质共同调节基因表达的机制。 幸运的是,科学就像它所属的那样,不受时间和空间的限制。它属于...
已知少数具有茎环结构或双链RNA延伸特异性的RBP可与一种独特的效应因子——RNA解旋酶UPF1相互作用，促进...
RNA聚合酶I、II和III的发现开辟了基因表达的新时代。在这篇文章中,James结合自己实验室的发展,回忆了DNA模板在RNA聚合酶II转录过程中发生了由裸露到染色质结合的转变这一发现的历史过程,强调了这些研究揭示了转录因子与染色质共同调节基因...
染色质结构的抑制作用阻止了DNA的开放性:如果基因被30纳米纤维包裹,大部分转录因子无法接近这部分DNA。 招募基本转录因子和RNA聚合酶 形成开放复合体,这就关系到TFIIH的活性。 启动子清除,关系到TFIIH的活性 RNA聚合酶II在启动子邻近区域会停顿,需要招募PTEFb来越过这个起始停顿位点 Segment 7: The Gal4 Domain Swappi...
例如,尽管cGAS对细胞质DNA的特异性高于RNA,但RNA病毒也可以激活cGAS-STING途径。一项研究表明,使用RNA病毒登革热病毒(dengue virus, DENV-2)感染人类细胞,导致细胞质中的线粒体DNA增加,并且伴随cGAS的激活,该研究解释了RNA病毒激活先天免疫信号的机制。与线粒体DNA在启动抗病毒免疫反应中的作用一致,TFAM缺陷细胞在感染...
美国洛克菲勒大学的Robert G. Roeder团队发表文章“Gene-Specific Control of tRNA Expression by RNA Polymerase II”，发现RNA聚合酶II（Pol II）在tRNA表达的基因特异性调控中发挥着直接和中心作用，它可以通过转录干扰动态调控Pol Ⅲ对tRNA的转录，这也是在血清饥饿期间，MAF1介导的对大量tRNA基因的抑制所必须的活性...
美国洛克菲勒大学的Robert G. Roeder团队发表文章“Gene-Specific Control of tRNA Expression by RNA Polymerase II”,发现RNA聚合酶II(Pol II)在tRNA表达的基因特异性调控中发挥着直接和中心作用,它可以通过转录干扰动态调控Pol Ⅲ对tRNA的转录,这也是在血清...
转录激活结构域: (1)带负电荷的螺旋结构,这种酸性螺旋结构特异性诱导转录起始的活性并不是很强,他们可能与TFIID复合物中某个通用因子或RNA聚合酶II本身结合,并有稳定转录起始复合物的作用。 (2)富含谷氨酰胺的结构,如SP1是启动子GC盒的结合蛋白,除结合DNA的锌指结构以外,SP1共有4个参与转录活化的区域,其中最强的...
第一类是酶特异性DNA-蛋白质共价结合体,这些是多种核酶 (例如拓扑异构酶(topoisomerases)、酪氨酸DNA磷酸二酯酶I (tyrosyl-DNA phosphodiesterase I, or TDP1), DNA和RNA聚合酶以及HMCES等) 的正常酶催化中间体。但在酶功能失调、内源性DNA损伤暴露或其特异性抑制剂处理下可能被捕获形成牢固且不可逆的交联【2...
ii:质谱鉴定,筛选出与DNA片段可能互作的蛋白信息(如某个或某些重要的转录因子/组蛋白等)。 DNA探针=顺式功能元件cis elememt 启动子是位于结构基因5'端上游的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确的结合并具有转录起始的特异性,调控转录起始时间和基因表达的程度。启动子(Promoters)就像“开关”,决定基因的...