重复序列过多,会增加基因合成的难度。利用该基因重复序列计算器,可以查找出序列中重复序列的位置,并计算出序列的退火温度。什么是重复序列?重复序列是指在基因组中不同位置出现的相同或对称性片段。重复序列在基因组中广泛存在,按照重复单元的排列方式,可将它分为串联重复序列和散在重复序列两大类,串联重复序列就是...
DNA序列中串联重复体查找算法研究 下载积分:1500 内容提示: 创新性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。 尽我所知, 除了文中特别加以标注和致谢中所罗列的内容以外, 论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果; 也不包含为获得西安电子科技大学或其它教育机构的学位...
msatr算法可以适用于各种不同相似度定义的dna重复片段的查找。分析和实验表明,msatr算法时间和空间复杂度为o(n)。实验结果表明,msatr算法有较好查找效率,并且msatr算法能得到较好的查找结果。关键词 dna序列挖掘;相似性重复片段;片段相似度;msatr;基 5、金项目:厦门大学校科研基金(0630-x01117);国家自然科学基金(...
dna序列中重复片段查找技术研究
题目: 重复的DNA序列:所有 DNA 都由一系列缩写为 A,C,G 和 T 的核苷酸组成,例如:“ACGAATTCCG”。在研究 DNA 时,识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。 编写一个函数来查找 DNA 分子中所有出现超过一次的 10 个字母长的序列(子串)。 思路: 滑动窗口法
基于PFD过滤器查找DNA序列中相似性重复片段