1.甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到扩增片段,则说明该位点存在甲基化;反之,说明...
甲基化检测能够有效识别癌症细胞和正常血液组织与细胞之间的黑白差异,是早期发现肿瘤的新检测方式。 一、什么是甲基化检测? 甲基化是一种DNA上的化学标记,自母体怀孕期间起就置入到人体DNA的不同位置,是基因“表观遗传”程序的一部分。当甲基化发生在基因中...
①癌症检测:DNA甲基化是癌症研究的重要领域之一,许多癌症类型都存在独特的DNA甲基化模式。通过检测癌症组织的DNA甲基化状态,可以用于癌症的早期诊断、预后评估以及复发监测等。例如,在肺癌、结直肠癌、乳腺癌等多种癌症中,通过检测某些基因的甲基化状态,可以预测患者的生存率和复发风险。②遗传性疾病检测:DNA甲基化...
DNA甲基化具有重要的生物学功能,科学家们开发了大量的方法检测DNA甲基化水平。 目前常见的DNA甲基化测定方法包括以下几类: 1.基因组甲基化水平的分析方法:包括高效液相色谱(HPLC)和高效毛细管电泳法(HPCE)。 2.候选基因甲基化分析方法:包括甲基化敏感性限制性内切酶-PCR/Southern法(MSRE-PCR/Southern)、重亚硫酸盐测...
通过比较合成序列中CpG位点掺入的C或T的荧光峰值比例,即可精确定量样本中该区域的甲基化水平。焦磷酸测序技术可有效应用于研究特定基因的调控元件或作为评估整体甲基化水平,也是当前检测DNA甲基化的“金标准”,但其无法区分5mC和5hmC。6、甲基化DNA免疫沉淀测序(Methylated DNA immunoprecipitation-sequencing,MeDIP-...
图5. 基于 HPLC-UV 的 DNA 甲基化检测[2] LC-MS/MS 如果采用色谱和串联质谱联用,可降低对起始 DNA 量的需求,起始 DNA 50-100ng 即可,还有文献报道用 5ng DNA 进行检测[3]。LC-MS/MS 对于不同质量的 DNA 没有偏好性,比如低质量的 FFPE 样本,这就像你吃东西的时候,不管你吃的山珍海味还是粗茶淡饭...
DNA甲基化:是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CPG二核苷酸的胞嘧啶5’碳位共价键结合一个甲基基因。其主要形式为5-甲基胞嘧啶(5-mC.、少量的N6-甲基嘌呤(N6-mA.及7-甲基鸟嘌呤(7-mG)。 DNA甲基化的检测方法: (1)重亚硫酸盐(亚硫酸氢盐)修饰:未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶;甲基化的胞嘧啶不发生...
我国肿瘤早筛市场,不乏基于DNA甲基化的早筛产品。早筛市场看似红火,但从知识产权角度来看,我国尚缺少具有独立知识产权的肿瘤甲基化标志物,国内甲基化检测产品多数要获得国外专利授权才能进行开发。从国内已获批的甲基化检测产品看,目前已有的17种甲基化检测试剂盒中,就有10个试剂盒的检测适应症为结直肠癌,甲基化...
(1) 全基因组重亚硫酸盐甲基化测序(WGBS) 全基因组重亚硫酸盐甲基化测序(WGBS)可以在全基因组范围内精确的检测所有单个胞嘧啶碱基(C碱基)的甲基化水平,是DNA甲基化研究的金标准。WGBS能为基因组DNA甲基化时空特异性修饰的研究提供重要技术支持,能广泛应用在...