DLO Hi-C 人类基因组包含大约20,000个蛋白质编码基因和大量的转录调控元件。研究表明,染色质状态以及三维结构对基因在的表达有着深远的影响。通过三维基因组与转录组、表观组等数据的联合分析,以及结合DNA-FISH实验对分析结果的验证,能够在表观遗传和基因表达调控网络层面上对生物体性状形成的相关机制进行精确解析。
连有接头的染色体片段进行T4DNA酶邻近酶连、超滤管浓缩、蛋白酶K消化、酚仿抽提,得到纯化后的DLOHi-C总DNA(TotalDNAofDLOHi-C),再用MmeI内切酶将DLOHi-C总DNA进行酶切消化,并用非变性Page胶回收释放出82bp左右的DLOHi-C片段(DLOHi-CDNAfragment),连上illumina高通量测序接头,PCR扩增,最终得到了DLOHi-Clibrary...
基因组三维结构在DNA复制,DNA损伤修复,基因转录调控中扮演着重要的角色.Hi-C是目前研究基因组三维结构的主要手段之一,但是存在背景噪音大,试验成本高,试验流程繁琐,缺乏对随机连接噪音的评价等缺陷,因而限制了三维基因组学的发展.为此,我们开发了一种简单经济的染色体构象捕获技术,即DLO Hi-C(digestion-ligation-only ...
DLO Hi--C Tool一款简单高效的DLO Hi--C分析工具 下载积分:2500 内容提示: 分类号: 觏:蘅硕士学位论文M A S TE R,S D E G RE E D I S S E RTATI O NMASTER’S DEGREE DISSERTATIoNDLo Hi.C T00l一款简单高效的DLo Hi.C分析工具DLo HI.C TooL AN EFFICIENT AND SIMPLE TooLFoRDLo HI.C ...
本发明公开了一种DLO Hi‑C染色体构象捕获方法,该技术克服了传统染色体构象捕获技术(Hi‑C)噪音大、成本高、实验过程繁琐、成功率低以及数据分析难度大等一系列缺陷,只需要简单的酶切酶连就可以进行实验。本发明的创新点在于:1)使用EGS和甲醛水溶液对目的细胞进行双交联,避免了后期实验过程中解交联的发生;2)实验...
本发明公开了一种DLO HiC染色体构象捕获方法,该技术克服了传统染色体构象捕获技术(HiC)噪音大,成本高,实验过程繁琐,成功率低以及数据分析难度大等一系列缺陷,只需要简单的酶切酶连就可以进行实验.本发明的创新点在于:1)使用EGS和甲醛水溶液对目的细胞进行双交联,避免了后期实验过程中解交联的发生;2)实验过程中不...
gen_qc_report Generate pipeline quality control report. infer_adapter Inference adapter sequence, and plot the... interactions_qc Count ratio of: inter-chromosome... noise_reduce Remove noise in DLO-HiC data. pipeline Generate integrated main processes... plot_contact_map Draw the Hi-C contact...
一种简便有效的植物长片段insituDLOHi-C测序文库的构建方法专利信息由爱企查专利频道提供,一种简便有效的植物长片段insituDLOHi-C测序文库的构建方法说明:本发明提供了一种简便有效的植物长片段in situ DLO...专利查询请上爱企查
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