DL_POLY是串行和并行分子动力学模拟软件包。DL_POLY目前有两个版本。DL_POLY_2是原始版本,用复制数据的方法并行化,适用于在100个处理器上模拟三万个原子的情况;DL_POLY_3的并行化使用区域分解,适用于在8至1024个处理器上,模拟百万量级的原子。对于一个DL_POLY许可,同时提供两个版本。DL_POLY还提供基于JAVA...
DL_POLY是一款经典的分子动力学模拟软件,旨在在分布式并行计算机上促进大分子、聚合物、离子系统和溶液的分子动力学模拟,应用于化学、物理学、材料科学等领域,能够帮助科研工作者研究材料的微观结构演化、相变过程、扩散现象、力学性能以及化学反应动力学等问题。 使用文档 暂无使用文档 常见问题 暂无常见问题 ...
DL_POLY Classic 是由 W. Smith、TR Forester 和 IT Todorov 在 Daresbury 实验室开发的通⽤分⼦动⼒学模拟包。它基于 DL_POLY_2包,该包最初由赞助下 Daresbury 实验室的前计算化学⼩组为 EPSRC 的凝聚相计算机模拟协作计算项⽬ ( ) 开发。DL_POLY Classic 可以作为串⾏或并⾏应⽤程序执...
DL-Poly软件 使用指南 DL-Poly 软件使用指南 2009年3月 中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心 1
DL_POLY的安装问题 DL_PLOY的安装步骤及注意问题: 这里所说的安装是指在Linux或Mac下安装 首先,下载官网的安装包,解压后,找到build文件夹下,发现会有四个Makefile文件,基本上如果并行运算只需要选择Makefile_MPI文件即可,注意:一般推荐这个,因为即使是你做串行运算也可以,然而如果选择了Makefile_SRVx文件,只能做...
用DL_POLY作辐照损伤计算的时候,看到很多文献都用的rigid ion model 模型,刚开始是用的软件里的rigid...
在服务器上用DLPOLY4做跨节点的并行计算,用openPBS提交后,报错。完整文件见附件。我们的服务器装的是...
DL_POLY2.16使用速成DL_POLY2.16使用速成 一软件的编译 1安装visual c 6.0对安装目录无要求,必须注意安装最后阶段,当问及是否在路径中设置环境变量时,一定选择是。 2安装Compaq Visual Fortran 6.5对安装目录无要求,必须注意安装最后阶段,当问及是否在路径中设置环境变量时,一定选择是。 3在windowsxp下安装linux模拟...
该存储库代表一组脚本和小型实用程序,以协助计算化学模拟(使用 DL_POLY、GROMACS 或 Towhee)。 这些工具用于帮助结构化学中心 (CQE) 的分子和工程热力学 (MET) 小组在葡萄牙 (PT) 里斯本大学 (UL) 高等技术研究所 (IST) 进行的研究. 每个工具都设计为使用尽可能少的参数和参数。 理想情况下,程序无需提供任何...
POLY和修改版的Gromacs支持外磁场,但Gromacs不会修改源代码,所以只能寄希望于DL_POLY了。不过在网上...