目的:通过此教程了解Discovery Studio软件中使用大量配体/大数据集中生成集合药效团 所需功能模块:Discovery Studio Client、Ensemble Pharmacophore Generation、Find Diverse Molecules、Common Feature Pharm…
Discovery Studio Client“ 服务器(server)- 客户端(client)”运行模式中,软件的可视化客户端。用于访问和使用服务器端的Discovery Studio软件。必须与服务器端配置的Pipeline Pilot Server 协同工作,为用户提供数据、工作流程和计算资源的共享。 Pipeline Pilot Server “服务器(server)- 客户端(client)”运行模式中,软...
所需功能和模块:Discovery Studio Client 所需数据文件:3pwh_dockedposes.dsv 所需时间:20分钟 介绍 分子之间的非键相互作用是生命体系中分子识别的基础。在基于结构的药物设计过程中,识别和优化配体分子和受体分子间的相互作用是一个基本过程,因此,全面细致的分析非键相互作用非常关键。 本教程将采用热稳定的腺苷A2A...
您要问的是discoverystudioclient在使用时出现无法访问的原因是什么吗？出现无法访问是不小心把jobs工作框删除和在分子对接过程中，受体配体对接失败。不小心把jobs工作框删除，解决方案：点击菜单栏view，??勾选jobs。在分子对接过程中，受体配体对接失败，解决方法：将文件的名称设置成非中文。（如果还不行...
Discovery Studio Client显示界面 综上:BIOVIA基本界面和显示模块提供基本的显示界面和分子模拟分析工具,比如来自Harvard大学Dr. Martin Kaplus的经典的分子力学和动力学模拟工具CHARMm。针对CHARMm动力学计算结果提供图形分析,分析和显示蛋白质、蛋白质与配体复合物的分子动力学轨迹文件。通过DS Standalone可视化界面或者命令行...
所需功能和模块:Discovery Studio client,DS_Ludi,DS_De novo evolution 所需数据文件:1fvv_protein.dsv, 1fvv_ligand.dsv 所需时间:10分钟 介绍 随着蛋白质结构解析技术的发展以及人类基因组计划的开展,对蛋白质晶体结构的研究发展迅速。怎样有效的分析这些靶点的信息以及设计出相匹配的分子是计算化学家面临的很大...
用户可以通过“客户端(client)—服务器(Server)”模式使用Discovery Studio软件。具有高质量图形界面的可视化客户端,和基于计算的服务器端,为用户提供了数据、工作流程和计算资源的共享和合作。 四、应用领域丰富广泛 Discovery Studio以生物大分子、配体小分子的设计与模拟为核心,研究领域包括且不限于:疾病的发病机理研究...
目的: 通过此教程,了解Discovery Studio中构建基于分子共同特征的药效团的操作方法及结果分析。 所需功能和模块:Discovery Studio Client,DS Catalyst Conformation,DS Catalyst Hypothesis,DS Catalyst Score。 所需数据文件:5HT2c_ligands.sd,sulfonamide5HT2c_ligands.sd,sampledrugs20.sd。
使用Discovery Studio进行自由能计算—Free Energy Perturbation 目的：采用Discovery Studio，以一组小分子化合物为实例，示范FEP计算及结果分析操作过程。所需功能：Discovery Studio client，DS Preparing analogs and ligand pairs、DS Setting up the relative FEP calculations、DS Running the FEP calculations、DS ...
Discovery Studio官方教程——使用MMPs识别生物活性 Discovery Studio MMPs教程 MMPs - Matched Molecular Pairs 所需功能和模块：Discovery Studio Client, DS QSAR.所需数据文件：bindingdb_cdk2.sd.所需时间：20分钟 介绍 构效关系（SAR）在药物化学中的应用是非常广泛的，主要分析化合物化学基团和生物效应之间的...