AI-enriched COMPUTATIONAL SIMULATION AI计算模拟 以AI、大数据分析及数字化工作流为基础的综合计算模拟解决方案
Discovery Studio,是基于 Windows/Linux 系统,面向生命科学领域的新一代综合建模与模拟平台。服务于生命科学领域的实验生物学家、药物化学家、结构生物学家、计算生物学家和计算化学家,主要应用于蛋白质结构功能研究、药物发现、酶工程、食品学、环境毒理研究等研究领域。通过高质量的图形界面、经多年验证的科学算法以及集...
关闭所有窗口,找到LibDock作业对应的output文件夹。结果文件默认保存在:文档 → discovery studio。在DS中打开View Results,Tools → Receptor-Ligand Interactions → view interactions → show 2D Diagram,Step through ligand上下箭头可切换不同的pose。 (3) 统计所有poses与蛋白之间的相互作用 View interactions → an...
Discovery Studio™ (简称DS)是专业的生命科学分子模拟软件,DS目前的主要功能包括:蛋白质的表征(包括蛋白-蛋白相互作用)、同源建模、分子力学计算和分子动力学模拟、基于结构药物设计工…阅读全文 赞同246 258 条评论 分享收藏 置顶分子模拟软件Discovery Studio教程(二):精准的分子对接技术 Disc...
Discovery Studio软件主要预测并通过以下结果来反映上述药物在体内代谢动力学过程: 水溶液溶解度:预测在25℃时化合物在水中的溶解度。 血脑屏障穿透:预测化合物的血脑屏障穿透。 CYP2D6结合:预测化合物细胞色素P450 2D6酶抑制。 肝毒性:预测剂量依赖性人类肝毒性的发生。
Discovery Studio基本操作 目的:通过此教程,了解并掌握Discovery Studio中一些基本操作。 所需功能和模块:Discovery Studio Visualizer client 所需数据文件:mdm_random.sd和1aq1.pdb。 所需时间:30分钟代算 …
Discovery Studio 官方教程(Help-Tutorials)创建3D QASR模型 采用能量格点作为描述符构建PLS模型(3D-QSAR)教程目的:通过此教程,了解并掌握Discovery Studio中构建三维定量构效关系模型的操作方法及结果分析。所需功能和模块:Discovery Studio Client,DS QSAR。所需数据文件:trainingset.sd,testset.sd。所需时… ...
Discovery Studio 八月Q&A Q1 如何从PDB数据库中选择蛋白晶体结构? 选择晶体结构的时候可以从以下几个方面加以考虑挑选: a. 可以参考已发表的同体系模拟的文献中所选的晶体结构,文献年限可以是新一点的; b. Resolution值低的比较好; c. 最好选带配体分子的复合物晶体结构,配体分子和对接的分子如果能比较类似则最...
Discovery Studio中包含一系列工具用于预测和优化抗体·抗原结合模式,识别抗体·抗原相互作用的关键残基;进行虚拟氨基酸突变提高抗体亲和力。 Ø抗体·抗原结合模式预测 利用刚性对接工具ZDOCK算法进行抗体·抗原的刚体对接,并根据抗原位置对结合构象进行聚类。此外,还可以使用ZRANK工具通过静电、VDW和去溶剂化能将对接结果进行...
核酸链的主链可以在Discovery Studio客户端中通过残基进行着色; 02 增强功能 (1)Perl脚本语言升级到5.36.0; (2)通过残基对核酸主链进行着色; (3)药效团理论的帮助信息现在包括,提供有关形状评分和药效团特征特性的详细信息; (4)动力学(Production)、动力...