AI-enriched COMPUTATIONAL SIMULATION AI计算模拟 以AI、大数据分析及数字化工作流为基础的综合计算模拟解决方案
Discovery Studio ActiveX Control. Now, using the ActiveX plug-in with Visualizer’s convenient 'storyboard' functionality, computational modelling experts can quickly and efficiently share interactive 3D visualisations of small molecules, proteins, nucleic acids, crystal ...
Discovery Studio,是基于 Windows/Linux 系统,面向生命科学领域的新一代综合建模与模拟平台。服务于生命科学领域的实验生物学家、药物化学家、结构生物学家、计算生物学家和计算化学家,主要应用于蛋白质结构功能研究、药物发现、酶工程、食品学、环境毒理研究等研究领域。通过高质量的图形界面、经多年验证的科学算法以及集...
使用Discovery Studio执行分子对接LibDock 分子对接是把配体分子放在受体活性位点位置,找到配体-蛋白之间有利的结合模式。Libdock分子对接速度快,但是精度低,常用于从小分子数据库里筛选出与蛋白活性位点匹配的小分子。Libdock得出的结合模式需由MD模拟或其他方法进一步验证合理性。此外,Libdock得到的配体-蛋白复合物可作为MD...
核酸链的主链可以在Discovery Studio客户端中通过残基进行着色; 02 增强功能 (1)Perl脚本语言升级到5.36.0; (2)通过残基对核酸主链进行着色; (3)药效团理论的帮助信息现在包括,提供有关形状评分和药效团特征特性的详细信息; (4)动力学(Production)、动力...
在Discovery Studio(DS)中,可以直接构建分子结构,也可以将在其它画图软件中画好的结构直接拷贝到DS中,本教程演示如何在DS中构建小分子结构。 调用Sketching功能 从View菜单下,打开Toolbars,选择Sketching。 Toolbars中将显示各种Sketching的工具,这些工具可以用来构建化合物的初始结构。
Discovery Studio™ (简称DS)是专业的生命科学分子模拟软件,DS目前的主要功能包括:蛋白质的表征(包括蛋白-蛋白相互作用)、同源建模、分子力学计算和分子动力学模拟、基于结构药物设计工… 阅读全文 赞同 258 221 条评论 分享 收藏
非键作用在Discovery Studio中有多个分类,主要是氢键、疏水作用、静电作用、卤素、其他。 1. 有利因素 ①氢键: Note: Classical:传统的氢键相互作用可以存在于氢键供体原子和受体原子之间。元素类型为N、O、P和S的原子被认为是经典的氢键供体原子,如果氢原子与这些原子连接,则被认为是氢键供体原子。在这种情况下,重...
在Discovery Studio中,我们可以使用ZDOCK来实现蛋白质的对接计算。ZDOCK是一种基于快速傅里叶转化相关性技术的刚性蛋白对接算法。算法中快速傅里叶转化相关性技术被用于搜索蛋白-蛋白系统的平动和转动空间。RDOCK是一种基于CHARMm的能量优化过程,用于优化ZDOCK所寻找到的蛋白-蛋白复合物的结合构型,并使用能量打分函数给这些...