我们主要来讲一下Dimer方法计算的一些注意事项。首先用CI-NEB方法计算一次过渡态，用nebresults.pl脚本处理得到结果后，通过neb2dim.pl脚本即可生成名为dim的文件夹，dim文件夹中的POSCAR和CI-NEB计算得到的鞍点接近，而MODECAR是按照之前的CI-NEB计算给出的Dimer寻找过渡态的初始矢量。下
过渡态通常处于能量面上的一阶鞍点位置。Dimer方法旨在让双体移动至一阶鞍点处。为有效移动，需准确计算双体所受的力。双体间相互作用能是计算力的关键因素。借助量子力学原理来精确计算相互作用能。不同的量子化学方法会带来不同计算精度。高精度计算往往伴随较大的计算量。要在计算精度和计算成本间寻求平衡。迭代过程...
dimer方法计算的结构比CI-NEB方法要少,所以可以用来在更高精度下计算鞍点。不过,dimer方法的搜索方向比较难控制,需要和其他方法相结合来计算反应过渡态,比如CI-NEB方法。
确认振动方向是自己心中的反应方向无误后即可提交计算，这里传一个模板dimer.inp。2.3 过渡态任务的实时...
如果马上就收敛了说明这个dimer的结果是你这个初态和末态的过渡态，如果不收敛说明你的初态和末态有...
本人使用VASP计算ZrO2负载镍铁团簇,在使用dimer算法计算甲烷干重整中甲烷分解第二步CH3-CH2+H的过渡态时,结构散架了,下图是初态、末态结构、输入文件以及计算过渡态过程中散架的结构 (请各位大神给出宝贵的意见) 初态 末态 计算过渡态过程中散架结构 输入文件 ...
DIMER | 这是过渡态搜索的另一种重要方法。 原理:定义了由两个点R1和R2组成的一个二聚体(可理解为一个哑铃)。这两个点的中间点为R,其受力为(F1+F2)/2,总能量为(E1+E2)/2。这个方法的每一步包括平移Dimer和旋转Dimer两步。 步骤:1-优化初末态结构 ...
请问各位 采用dimer计算过渡态的题中断了 能不能接着算？另外，如何分析dimer计算的结果？
首先用CI-NEB方法计算一次过渡态,用nebresults.pl脚本处理得到结果后,通过neb2dim.pl脚本即可生成名为dim的文件夹,dim文件夹中的POSCAR和CI-NEB计算得到的鞍点接近,而MODECAR是按照之前的CI-NEB计算给出的Dimer寻找过渡态的初始矢量。下面主要说一下Dimer方法的INCAR。
首先用CI-NEB方法计算一次过渡态,用nebresults.pl脚本处理得到结果后,通过neb2dim.pl脚本即可生成名为dim的文件夹,dim文件夹中的POSCAR和CI-NEB计算得到的鞍点接近,而MODECAR是按照之前的CI-NEB计算给出的Dimer寻找过渡态的初始矢量。下面主要说一下Dimer方法的INCAR。