dinifti: dinifti 下载链接[6], 用C语言编写的,专注于Siemens数据的转换 dicm2nii: 用Matlab编写的。Matlab语言使得这个工具非常易于脚本化。它试图保留扩散梯度信息。dicm2nii 下载链接[7] dicom2nifti: 看起来很有前途:可使用命令行,也可以在python中调用 dicom2nifti 下载链接[8]。 dcmstack: Python编写的...
@文心快码python dicom转nii 文心快码 要将DICOM文件转换为NIfTI(.nii)文件,你可以使用Python中的几个库来完成这一任务。以下是一个详细的步骤指南,包括所需的库、代码示例以及验证步骤: 1. 查找并安装适当的Python库 你需要安装pydicom库来读取DICOM文件,以及nibabel库来写入NIfTI文件。如果希望使用更高级的功能,如...
-b: BIDS sidecar:(“-b y”或“-b n”, 默认为 y)如果选择“yes”,则软件将生成与NIfTI图像同名的一种Brain Imaging Data Structure文件。该文件采用JSON文本格式,提供了有关扫描的附加信息,这些信息无法保存在NIfTI头文件...
Vol.1 前言 在上一次推文中(如何将 DICOM 格式的图像转换为 NIfTI/BIDS 格式(一)https://mp.weixin.qq.com/s/Xm6S3H_m07scXH4F_v9zBA,我们详细介绍了DICOM,NIfTI和BIDS格式,以及如何将DICOM格式的图像转换为NIfTI格式,在本次推文中我们将介绍如何整理成符合BIDS标准的文件结构。 Vol.2Docker 在最开始,需要安...
import dicom2nifti #DICOM文件存放位置 original_dicom_directory = 'E:\\PostGraduate\\Github\\DicomImagePreprocessing\\PinLiangDICOM\\Lung\\118PCT' #要生成的nii文件名 output_file = '118PCTnii' dicom2nifti.dicom_series_to_nifti(original_dicom_directory, output_file, reorient_nifti=True) ...
2. 实现方法 python下直接调用函数就行(感谢造轮子大佬) import dicom2nifti dicom2nifti.convert_directory(dicom_directory, output_folder, compression=True, reorient=True) 其中dicom_directory是包含dicom文件的路径,比如下面这个,20200722下面三个文件夹下都包含dicom数据(这可能是因为医院扫描序列不同或者扫描部位...
...来源: https://www.leadtools.com/sdk/medical/dicom-spec1 Pydicom 是用于读取 DICOM 文件的 Python 库,详情请参阅文本第一部分的代码示例...使用 oro.dicom 工具包来读取未压缩的 DICOM 文件 NIFTI 格式的基本内容 “神经成像信息技术创新” 将 NIFTI 格式视为 ANALYZE7.5 格式的替代品。...DICOM 和 ...
医学影像是由磁共振成像（MRI），计算机断层扫描（CT）和正电子发射断层扫描（PET）等系统产生的。它们...
请注意,DICOM文件中可能包含多个图像(例如,多个切片),可能需要根据具体需求进行适当的处理。 此外,还可以使用其他库,如SimpleITK、dicom2nifti等,根据项目需求选择合适的库。 野牛程序员教少儿编程与信息学奥赛-微信|电话:15892516892
To run the dcm2niix task from pydra.tasks.dcm2niix import Dcm2Niix task = Dcm2Niix(in_dir='/path/to/dicom/dir', out_dir='/path/to/create/nifti/output') result = task() However, the converter task interface will typically be used as the first step within larger Pydra workflows...