针对药物设计、药物研发等提供基于Discovery Studio、COSMOLOGIC等软件的ADME、构象比对、溶剂筛选、结晶、成盐、共晶筛选、稳定性、溶解度pKa、分配系数等性质的模拟预测软件及方案。 化工设计 面向精细化工、新能源、石油化工等领域提供精馏萃取...
然而,MOFs 通常被用作被动填料,深入揭示 MOFs 与聚环氧乙烷(PEO)之间的结合模式、MOFs 在促进固体电解质中 Li+ 传输的关键作用充满挑战。 本文在密度泛函理论(DFT)的启发下,根据实验结果和分子动力学(MD)模拟,报道了具有丰富不饱和金属...
在表面活性剂存在的情况下,膜的突破压力高达20bar。 DFT计算和MD模拟揭示了水凝胶链和污染物之间的相互作用减轻了表面活性剂的积累,破坏了表面活性剂在蒸发表面的有序分布,并保护了膜免受润湿。 研究者还证明了该膜在处理含有高浓度表面活性剂、矿物油和NaCl的合成废水的实际应用中的稳定性能。 结果表明,在保证膜...
在原子层面上的仿真模拟主要有DFT方法和MD方法;其中DFT方法可以模拟精确的化学反应,获得反应路径和反应机理的信息,但是DFT模拟的尺度比较小,难以适用于复杂的体系;MD方法可以模拟更大空间尺度的模型结构,并且具有较高的效率,但是经典动力学无法表达体系中的化学反应。把两种方法结合会在模拟效率和精度上有重要的意义。特...
1.1. 计算模拟发展:MD, MC, DFT三大部分 1.2. 人工智能时代背景: 大数据与大模型对模拟计算的影响 1.3. 人工智能加入给传统模拟计算带来的哪些变化? ① 模型建构的新趋势 ② 力场开发中的机器学习应用 ③ AI 在模拟过程优化与加速中的作用 ④ 数据后处理技术的发展与智能化 ...
几何结构优化不收敛与优化算法的局限性相关,也与模型结构本身不够稳定有关。可采用状态方程法,AIMD方法调整结构后优化,也可以换优化算法逐步优化。 MD模拟原子丢失,除力场参数本身外,改变边界条件,测试晶格参数重新建模,进行能量最小化,多步弛豫与调模拟参数可解决问题。(忽略原子丢失的报错往往只会得到错误的模拟结果...
在Materials Studio(MS)中,我们可以进行一系列与分子化合物相关的计算,包括但不限于: 能级轨道计算:如HOMO和LUMO分子轨道的能量。 静电势计算:了解分子的电势分布。 分子间相互作用:研究氢键、配位键等弱相互作用。此外,我们还可以进行聚合物三维建模,计算能带、吸附能、能带结构、态密度、差分电荷密度图以及电偶极矩...
据说跑md的话，nose-hoover温控只能cpu用。nose-hoover温控一般认为是模拟动态过程（包括但不限于扩散率...
通过DFT计算和MD模拟，研究者揭示了表面活性剂与水凝胶链之间的强相互作用如何阻碍表面活性剂分子向液-气界面和疏水壁面的迁移，进而减轻蒸发界面上的表面积累和重新分配低表面张力污染物。研究者还进行了MD模拟，显示了水凝胶改性膜在连续蒸馏96h后仍保持超稳定的性能，而商业PTFE膜在运行约3min后就失效...
1. 密度泛函理论(DFT)计算:研究者利用DFT计算来生成全局神经网络(GNN)势能面探索所需的训练数据集。DFT计算采用了平面波基组、泛函为广义梯度近似(GGA-PBE)、动能截止能量为450 eV,并使用投影增强波(PAW)伪势来描述离子核心电子。通过DFT计算,研究者优化了结构,直至每个原子的总力小于0.01 eV/Å。