宏基因组——深度学习工具DeepARG在Linux安装中的问题 Microbiome在2018年发表了一篇基于深度学习鉴定抗性基因的工具DeepARG() 按照上的说明,对DeepARG在Linux系统上进行了安装 利用python的pip 进行安装: 1)首先运行 pip install nolearn 成功安装,提示信息为 “Installing col
为了解决这些限制,作者在这里提出一种深度学习方法,使用所有已知的ARGs类别创建的不同矩阵。分别针对短读长序列和全基因长度序列构建了两种深度学习模型:DeepARG-SS 和DeepARG-LS。 对30个抗生素耐药类别的深度学习模型的评价表明,DeepARG模型可以同时预测高精度的ARGs(>0.97)和召回率(>0.90)。与典型的best hits方法相比...