在 DESeq2 中,通常会根据基因的表达水平和差异表达的统计显著性进行筛选。一般来说,可以根据需求设定一定的表达量阈值和统计学上的显著性阈值,比如可以设定 log2 折叠变化 > 1 或 < -1,调整的 p 值 < 0.05 等作为筛选条件。这些阈值的设定应该结合具体的实验设计和数据特点来确定,以保证差异分析的准确性和...
谢谢谢谢是的 ，DESeq2要求输入的是readcount 值 为整数，你这数据不是整数不能输入；...
dds是一个DESeqDataSet对象,其中包含了RNA-Seq数据和样本信息。它是DESeq2进行差异表达分析的基础对象。在使用DESeq2之前,需要准备一个dds对象。 为了确定DESeq2中的dds阈值,需要按照以下步骤进行操作: 1.安装和加载DESeq2包 在R环境中,首先需要安装并加载DESeq2包。可以使用以下命令安装DESeq2包: install....