DNA亲和纯化测序(DAP-seq)作为一种近年新兴的用于研究蛋白质-DNA相互作用的表观遗传学技术,对于探究转录因子调控网络方面发挥着重要的作用。相较于Chip-seq,DAP-seq技术最大的优点在于采用体外表达标签蛋白,将表达产物与目标基因组序列进行结合,完美回避了非模式生物长期面临的缺少蛋白抗体的窘境。 基迪奥的DAP-se
DAP-seq是一种用于研究蛋白质与DNA相互作用的高通量测序技术。这项技术通过将目标蛋白与基因组DNA结合,然后进行亲和纯化和测序,能够快速鉴定蛋白质在全基因组范围内的结合位点。DAP-seq操作简单,成本较低,适用于研究转录因子等DNA结合蛋白的功能。它不依赖于特异性抗体,可以直接使用重组蛋白,因此在实验中具有较高的灵...
ChIP），是研究体内蛋白质与DNA相互作用的经典方法。将ChIP与高通量测序技术相结合的ChIP-Seq技术，可在...
DAP-seq是研究在体外状态下蛋白质-DNA互作的技术;ChIP-seq是研究在体内自然状态下蛋白质-DNA互作的技术。 DAP-seq 是用来揭示基因组范围内某个蛋白质(通常是转录因子)的结合位点,进而预测下游的靶基因,而且不需要抗体,也不限物种,尤其适用于植物领域的研究;ChIP-seq如上所述,是一种常见的用来发现转录因子结合位点...
DAP-SEQ技术简介 DAP-SEQ是基于DNA亲和纯化，通过体外表达转录因子鉴定TFBS的技术，具有不受抗体和物种限制，且高通量的优势，自该技术问世以来，已被广泛应用于转录调控和表观组学的研究。那么关于DAP-SEQ都有哪些问题需要关注呢？1. DAP-seq原理、技术流程，能解决什么样的问题?原理：体外表达的蛋白和...
DAP-seq原理是什么?视频讲解 2 年前 南京钟鼎生物 筚路蓝缕,以启山林关注DNA亲和纯化测序(DAP-seq)的原理 0发布于 2022-09-23 15:29 推荐阅读 再谈变分自编码器VAE:从贝叶斯观点出发 Pape... · 发表于PaperWeekly 【分子对接教程】小分子-小分子对接(Vina) 殷赋科技 Abaqus内置LaRC05失效准则子程序介绍 ...
3. DAP-seq信号分析：分析序列比对结果，检测DAP-seq信号，评估其丰度和定位精度。4. 差异表达分析：比较不同样本之间的DAP-seq信号，筛选差异表达的基因或位点。5. 生物信息学分析：利用生物信息学方法，对差异表达基因或位点进行功能注释和路径分析，挖掘其生物学意义。五、结果解读与报告撰写1. 结果解读：对数据...
DAP-seq确定两种bZIP转录因子AhHYH和AhHY5在花生光信号调控中的调控网络 英文标题:Determination of the regulatory network of two bZIP tranion factors,AhHYHandAhHY5, in light signal regulation in peanut by DAP-seq 发表期刊:Current Plant Biology ...
DAP-SEQ技术简介 DAP-SEQ是基于DNA亲和纯化,通过体外表达转录因子鉴定TFBS的技术,具有不受抗体和物种限制,且高通量的优势,自该技术问世以来,已被广泛应用于转...
想了解这个转录因子在转录水平上可以调控哪一些蛋白的表达,这个时候呢,经典的方法是Chip-seq,但是手头上...