文章借助转录组与DAP-seq确立了SITPL3与SIWUS互作,调控激素相关基因表达,形成对花和果实发育影响的调控机制,并以多种实验完成了结果的确认。 图3 A. WT和三株SITPL3 RNAi植株的SITPL3表达量;B. WT和三株SITPL3 RNAi植株的植株高度;C. WT和三株SITPL3 RNAi植株的花的器官数量统计;D. RNA-seq RNAi植株与WT植...
为了更好地理解FvRIF介导的果实成熟的转录调控,作者进行了DAP-seq来找寻FvRIF结合位点;在两个生物重复中检测到总共9902个富集峰,对应于7899个基因(图2A),并且结合位点高度集中在转录起始位点(TSS)上(图2B);大多数结合位点(37.0%)位于启动子区内(TSS上游2kb)(图2C),这与FvRIF是一种具有DNA结合能力和基因调控...
该研究借助DNA亲和纯化测序(DNA Affinity Purification Sequencing,DAP-seq)技术,深入揭示了胡杨耐盐的分子机制。
leaf senescence and nitrogenremobilization的研究论文,该文章借助DAP-seq和RNA-seq技术,在模式植物拟南芥中揭示了逆境响应转录因子WRKY1通过直接调控开花、叶片衰老和氮素再利用途径的相关基因来调控一次结实性植物衰老的分子
DAP-seq高通量地检测转录因子在基因组上的结合位点,鉴定下游靶基因。蓝景科信拥有100+物种,2000+转录因子的DAP-seq实验经验。我们使用该技术已助力客户在许多期刊成功发表文章,例如:Cell,Molecular Plant,The Plant Cell,Plant Physiology,Plant Biotechnology Journal,Journal of Integrative Plant Biology,New Phytologist等...
该期刊的影响因子为7.947。该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术鉴定了玉米中一个AP2/ERF转录因子的结合基序以及靶基因。揭示了ZmEREB57通过两个不同的信号途径调控玉米OPDA合成增强耐盐性的分子机制,为耐盐性植物新品种的培育提供了重要的遗传资源。
该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术鉴定了杨属YABBY11转录因子的结合基序和靶基因。发现YABBY11与杨树叶形自然变异显著关联,为探索理想叶形遗传改良奠定了理论基础。 该研究发现,在毛白杨基因组中,YABBY11由于存在提前终止位点(PtoYAB11PSC),从而导致锌指结构域缺失,进而失去了对下游靶基因PtoNGAL-1与PtoRBCL的...
DNA亲和纯化测序(DAP-seq)结果显示,ZmR1CQ01靶向了1010个基因,其中包括花青素合成途径中的Bz2。RNA-seq分析显示,ZmR1CQ01靶向的55个基因的表达水平显著改变,其中类黄酮和苯丙素生物合成途径中关键酶的基因表达显著上调。随后,又开发了ZmR1功能分子标记物。以上结果揭示了转录调控和序列变异对ZmR1功能的影响,并在全...
DNA亲和纯化测序(DAP-seq)结果显示,ZmR1CQ01靶向了1010个基因,其中包括花青素合成途径中的Bz2。RNA-seq分析显示,ZmR1CQ01靶向的55个基因的表达水平显著改变,其中类黄酮和苯丙素生物合成途径中关键酶的基因表达显著上调。随后,又开发了ZmR1功能分子标记物。以上结果揭示了转录调控和序列变异对ZmR1功能的影响,并在全...
研究发现，转录因子MeGI通过调控昼夜节律、水杨酸生物合成和类黄酮生物合成途径中的基因，影响油柿的性别控制功能。该研究使用ChIP-seq、DAP-seq、RNA-seq和EMSA等技术，结合油柿和拟南芥的实验，揭示了MeGI的调控机制。油柿MeGI基因能抑制拟南芥雄蕊的发育，通过ChIP-seq、DAP-seq和RNA-seq的联合分析，鉴定出...