答案是:此图是测序reads的可视化,利用reads和参考基因组比对之后的结果,用来展示目标基因上的转录因子结合/组蛋白修饰/染色质开放性的。" 鉴定转录因子在基因组上结合常用的技术手段是ChIP-seq/DAP-seq,检测组蛋白修饰的全基因组分布用ChIP-seq/CUT&Tag,而对染色质可及性的检测则用ATAC-seq。ChIP-seq/DAP-seq/...
DAP-seq的优势:不需要针对每个转录因子制备特异性抗体,快速、高通量、节约时间成本。 11. DAP-seq用的input是什么,为什么选这个作为对照呢? Input对照是用的亲和纯化前的文库,目的是降低背景噪音,我们用的Input和2016年发表在Cell(DAP Seq-Cistrome and Epicistrome Features Shape the Regulatory DNA Landscape)上的...
1、 凝胶阻滞实验(EMSA):DAP-seq后续验证服务。 2、 酵母单杂交:DAP-seq后续验证服务 3、 ChIP-seq:高效检测重组蛋白、转录因子在基因组的结合位点 4、 DAP-seq与RNA-seq联合分析: 分析转录因子的靶基因在RNA-seq数据中的表达变化,深入挖掘DAP-seq和RNA-seq测序数据,增加转录组测序的分析深度。 5、 DNA-pull...
答案是:此图是测序reads的可视化,利用reads和参考基因组比对之后的结果,用来展示目标基因上的转录因子结合/组蛋白修饰/染色质开放性的。 " 鉴定转录因子在基因组上结合常用的技术手段是ChIP-seq/DAP-seq,检测组蛋白修饰的全基因组分布用ChIP-seq/CUT&Tag,而对染色质可及性的检测则用ATAC-seq。ChIP-seq/DAP-seq/...
3. 分析结果包括哪些内容? DAP-seq的生信分析包括以下内容: 1.对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 reads 的处理 2.数据产出统计 3.参考序列比对分析 4.测序reads富集区域扫描(peak calling) 5.Peak长度分布统计 6.Peak在基因功能元件上的分布统计 ...
答案是:此图是测序reads的可视化,利用reads和参考基因组比对之后的结果,用来展示目标基因上的转录因子结合/组蛋白修饰/染色质开放性的。 " 鉴定转录因子在基因组上结合常用的技术手段是ChIP-seq/DAP-seq,检测组蛋白修饰的全基因组分布用ChIP-seq/CUT&Tag,而对染色质可及性的检测则用ATAC-seq。ChIP-seq/DAP-seq...
3. 分析结果包括哪些内容?蓝景科信DAP-seq的生信分析包括以下内容:1.对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 reads 的处理 2.数据产出统计 3.参考序列比对分析 4.测序reads富集区域扫描(peak calling)5.Peak长度分布统计 6.Peak在基因功能元件上的分布统计 7.Peak序列模式发掘(motif search)8....
3. 分析结果包括哪些内容? 蓝景科信DAP-seq的生信分析包括以下内容: 1.对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 reads 的处理 2.数据产出统计 3.参考序列比对分析 4.测序reads富集区域扫描(peak calling) 5.Peak长度分布统计 6.Peak在基因功能元件上的分布统计 ...
3. 分析结果包括哪些内容? 蓝景科信DAP-seq的生信分析包括以下内容: 对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 reads 的处理 数据产出统计 参考序列比对分析 测序reads富集区域扫描(peak calling) Peak长度分布统计 Peak在基因功能元件上的分布统计 Peak序列模式发掘(motif search) ...