在序列的上下游分别找到两段保守的区域设计交叉引物,而鲌鱼线粒体d-loop区全长大概在940bp左右,而第一代测序一个反应有效测序量大概在700bp左右,因此通过一次正反向测序,利用交叉引物获得的序列重叠区域进行拼接、剪切、比对后,即可得到待测鲌鱼的d-loop区全序列。
鸡mtDNAD-loop区全序列扩增及测序用引物,见序列表SEQIDNO.1、SEQIDNO.2、SEQIDNO.3。扩增及测序方法,包括以下步骤:(1)提取鸡羽毛中的DNA,并检测质量;(2)在鸡mtDNAD-loop区上下游保守区域设计一对PCR引物(见序列表SEQIDNO.1、SEQIDNO.2),通过PCR反应扩增包含Cytb基因的片段,经琼脂糖电泳检测;(3)设计...
应用D基因D基因设计的引物Dloop引物设计简并引物通用引物 淡水鱼类线粒体DNA D-loop基因的引物设计和应用,淡水鱼类线粒体DNA D-loop基因的引物设计和应用应用,D,基因,D基因,设计的引物,Dloop,引物设计,简并引物,通用引物,应用,D,基因,D基因,设计的引物,Dloop,引物设计,简并引物,通用引物 ...
[0056] (2)在鸡mtDNA D-loop区上下游保守区域设计一对PCR引物,通过PCR反应 扩增包含Cytb基因的片段,经琼脂糖电泳条带单一、亮度高;所述PCR引物的上游引物 为:5'-AAACACCCAAACTCACTAAC-3',PCR 引物的下游引物:5'-CACTGGGATGCGGATACTTGC-3' ;[0057] (3)设计测序引物对所述PCR产物进行测序,所述测序引物为...
本发明涉及生物基因组研究领域,具体公开了一种鲌鱼D‑loop区全序列测序专用引物及应用,本发明**采用简并引物进行PCR扩增,然后再以专用引物进行测序。本发明的D‑loop全序列测序方法具有成本低,易掌握,只需一次正反测序就可以得到全序列的优点,从而为鲌鱼地理种群鉴定、分子遗传学、分子系统进化学研究以及早期资源鉴...
一种利用d-loop区突变位点鉴定确山黑猪的方法,该方法包括如下步骤: (1)提取待鉴定品种基因组dna 具体例如采用酚氯仿法进行提取; (2)设计引物 基于第474位碱基序列进行判定时: 在d-loop区基因第474位碱基的上游和下游设计pcr扩增用引物序列(如seqidno.1~2所示)如下: ...
鸡mtDNAD‑loop区全序列扩增及测序用引物,见序列表SEQIDNO.1、SEQIDNO.2、SEQIDNO.3。扩增及测序方法,包括以下步骤:(1)提取鸡羽毛中的DNA,并检测质量;(2)在鸡mtDNAD‑loop区上下游保守区域设计一对PCR引物(见序列表SEQIDNO.1、SEQIDNO.2),通过PCR反应扩增包含Cytb基因的片段,经琼脂糖电泳检测;(3)...
本文选取已测定的主要淡水鱼类的线粒体DNAD2loop基因序列进行同源性比较,寻找保守序列,利用简并性原则设计一对通用的简并引物。利用设计的引物对广东省珠江流域主要的淡水鱼类线粒体DNAD2loop控制区基因进行扩增,均能获得单一的目的DNA片断,特异性扩增产物大小为1kb左右。经测序及与GenBank同源序列的比较,证实为包含...
它包括如下步骤:(1)分别提取鱼类基因组DNA和线粒体DNA;(2)在鱼类线粒体DNA D-loop控制区设计简并引物:其上游引物MitD1-F有21个碱基:CAC CCY TRR CTC CCA AAG CYA;下游引物MitD1-R有23个碱基:GGT GCG GRK ACT TGC ATG TRT AA;(3)在引物的作用下进行PCR反应;(4)琼脂糖凝胶电泳;(5)对扩增的mtDNA ...
摘要 本发明是一组三疣梭子蟹D-LOOP基因的微卫星引物,其特征在于,先采集三疣梭子蟹提取基因组DNA,通过PCR扩增三疣梭子蟹的D-LOOP基因并进行双向测序,通过TRF程序来查找三疣梭子蟹的D-LOOP基因微卫星位点并开发出一组微卫星引物。本发明筛选出的引物扩增产物清晰、稳定、多态性好,可应用于三疣梭子蟹的种质评价和种质...