Cytoscape的数据挖掘主要是用到“筛选”工具。网络图常见的筛选方式是利用连通性筛选关键基因,Cytoscape可以直接计算点的连通性(K),点击菜单栏Tools->NetworkAnalyzer->Network analysis->Analyze Network,点击确认,连通性数据就会出现在“点信息页”,列名为“degree”。操作界面如下图: 点击筛选模块,新建筛选条件,在下拉...
首先，确保你已下载并安装了Cytoscape。从“File”菜单导入STRING互作分析结果数据，如“string_interactions_short.tsv”，数据包含节点1和节点2的互作关系及分数。通过“Import”->“Network from File”进行导入，选择合适的节点后进行网络化分析。如果你需要定制节点展示，如基因数量较多，可以创建新的展示...