CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)作为一种研究DNA与蛋白质互作的新技术,是ChIP-seq技术的升级版本,具有高分辨率,低细胞投入量,操作流程简便高效等优势,可应用于研究表观遗传修饰、转录因子结合位点等方面,其强大优势为生命科学研究开辟了新的道路。小编精选了两篇文章【乳酸化修饰+CUT&Tag联合解决方案...
文章结果第一次表明m1A可以激活肿瘤抑制因子，以及组蛋白乳酸化、mRNA的m1A修饰和PML凝聚体形成之前的关联，为肿瘤的治疗提供了新的靶点和有效的治疗方案。文中CUT&Tag和ChIP-seq由嘉因生物协助完成。
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是一种新型DNA-蛋白互作研究技术,主要用于研究转录因子或组蛋白修饰在全基因组上的结合或分布位点。相比于传统的ChIP-seq技术,CUT&Tag反应在细胞内进行,创新性地使用了ProteinA/G-Tn5融合蛋白来结合目的蛋白上的抗体,并特异性切割目的蛋白结合的DNA,最终通过结合NGS实...
CUT&Tag 将接头整合到 antibody-tethered pA-Tn5 附近的 DNA 中,整合的确切位点受到周围 DNA 可及性的影响。出于这个原因,具有相同的起始和结束位置的片段应该是常见的,并且这种“重复”可能不是 PCR 过程中产生的重复。在实践中,我们发现高质量的 CUT&Tag 数据集的 apparent 重复率很低,即使是 apparent “重复...
虽然CUT&Tag相较于ChIP-seq有了很大的改进，但仍有难题横在眼前：一次实验只能绘制一种染色质蛋白图谱；无法直接检测同一细胞中不同染色质蛋白质的共结合。本文描述了一种方法，multi-CUT&Tag，能在样本有限的情况下通过一次实验同时绘制同一样本中多个染色质蛋白质图谱，并且可用于分析不同染色质蛋白的共定位。实验...
尽管CUT&Tag与ChIP方法在某些方面类似,但CUT&Tag实验的起始材料是活的可渗透细胞或分离的细胞核,而不是ChIP-seq中使用的甲醛交联的细胞或组织。CUT&Tag有望将蛋白与染色质DNA互作的研究变成了一种类似PCR反应的常规操作,对基因调控、表观遗传等领域的研究具有重要的意义。
6 Peak calling - M1 SEACR mkdir -p $projPath/seacr seacr="/lustre/home/yfxie/.conda/envs/cuttagg/bin/SEACR_1.3.sh" cat $config1 | while read line do arr=($line) sample=${arr[0]} ## top0.01和top0.05,因为没有做IgG样本 ...
CUT-Tag互作技术服务-研究DNA与蛋白互作(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是研究DNA与蛋白互作的新技术。与ChIP-Seq相比,CUT&Tag不需要甲醛交联和免疫共沉淀的过程,而是通过靶蛋白的抗体和Protein A的介导,使Protein A融合的Tn5转座酶靶向并切割DNA,同时在序列两端加上测序接头,经PCR扩增后形成高通量测序文库...
一步法RT-qPCR试剂盒 SYBR绿色荧光定量试剂(One Step rt-qpcr Kit) ￥175.00 查看详情 DNA建库试剂盒(Hieff NGS® dna Library Prep Kit) ￥2755.00 查看详情 磁珠法土壤/粪便DNA提取试剂盒 MolPure® Mag Soil/Stool dna Kit ￥605.00 查看详情 血液DNA提取试剂盒|MolPure® Blood DNA Kit(50T) ￥...
根据公开的科研数据显示,甲醛重交联是指通过甲醛将细胞内的蛋白质和DNA之间形成稳定的化学连接,具备迅速固定样品的优势。而通过将这一方法应用于CUT&Tag技术,研究者能够更为清晰地捕捉到那些本身存在弱相互作用的蛋白质-DNA复合物,这是传统方法无法轻易实现的。