2021年,华中农业大学李兴旺团队在Frontiers in Plant Science上发表了题为“Rapid and Low-Input Profiling of Histone Marks in Plants Using Nucleus CUT&Tag”的研究论文,作者在籼稻和油菜中利用nCUT&Tag(nucleus CUT&Tag)技术提取少量细胞核,即可识别H3K4me3和H3K9me2的组蛋白修饰位点,并且可在一天内完成实验 (Ou...
1. 不同氮素条件下组织特异性染色质景观分析 使用CUT&Tag方法对小麦品种KN9204和J411在NN和LN条件下的根(28天)、旗叶(抽穗期)和籽粒(开花后21天)进行了染色质表观遗传修饰的谱系分析(fig.1a),以揭示转录调控的表观遗传调控机制。结果表明,该方法在小麦中的有效性得到了充分验证,与先前发表的ChIP-seq数据相比...
2020年,浙江大学关雪莹团队在Plant Methods发表了题为“Efficient chromatin profiling of H3K4me3 modification in cotton using CUT&Tag”的研究论文,基于动物细胞中CUT&Tag的文库构建方法,作者开发了一套在植物中构建CUT&Tag文库的方法,并比较了棉花叶片CUT&Tag与ChIP-seq的文库构建效率。与ChIP-seq相比,CUT&Tag处理...
近日，哈尔滨医科大学附属第二医院心内科于波、张毛毛、吴健教授课题组在Circulation Research (IF=23.213)上在线发表了题为“Histone Lactylation Boosts Reparative Gene Activation Post Myocardial Infarction”的研究论文，研究揭示组蛋白乳酸化可通过促进修复基因的转录来调节单核-巨噬细胞的抗炎和血管生成的双重活性...
论文题目:The phosphatase PAC1 acts as a T cell suppressor and attenuates host antitumor immunity 发表期刊:nature immunology 组学技术:RNA-seq,ATAC-seq,CUT&Tag 影响因子:23.53 研究背景 癌症的发展和迁移是集体免疫系统与肿瘤细胞相互博弈的结果。癌细胞通过抑制T细胞的效应功能来逃避免疫系统的监视。因此,阐明...
为了鉴定心梗后单核细胞中H3K18la的靶基因,作者结合CUT&Tag和RNA-seq数据,根据基因的表达和H3K118la修饰将基因分为4类:上调基因有或无差异H3K17la,下调基因有或没有差异H3K18la(图3E)。通过对两类H3K18la修饰基因的从头基序搜索,作者发现H3K118la的上调和下调基因具有不同的富集DNA序列(图3F)。GO分析显示,...
nitrogen availability in wheat”的研究论文,该文章聚焦两个低氮下生长存在差异的代表性小麦品种:科农9204 (KN9204)和京411 (J411),并分别在正常氮(Normal nitrogen, NN)和低氮(Low nitrogen, LN)条件下,利用CUT&Tag技术(爱基百客可提供该技术服务)绘制了这两个品种各三种组织(根、旗叶、种子)的多种组蛋白...
近日,哈尔滨医科大学附属第二医院心内科于波、张毛毛、吴健教授课题组在Circulation Research(IF=23.213)上在线发表了题为“Histone Lactylation Boosts Reparative Gene Activation Post Myocardial Infarction”的研究论文,研究揭示组蛋白乳酸化可通过促进修复基因的转录来调节单核-巨噬细胞的抗炎和血管生成的双重活性,促进...
为了鉴定心梗后单核细胞中H3K18la的靶基因,作者结合CUT&Tag和RNA-seq数据,根据基因的表达和H3K118la修饰将基因分为4类:上调基因有或无差异H3K17la,下调基因有或没有差异H3K18la(图3E)。通过对两类H3K18la修饰基因的从头基序搜索,作者发现H3K118la的上调和下调基因具有不同的富集DNA序列(图3F)。GO分析显示,...
2023年11月，中山大学肿瘤防治中心林东昕/郑健研究组在Nature Genetics上发表学术论文“Super-enhancer RNA m6A promotes local chromatin accessibility and oncogene transcription in pancreatic ductal adenocarcinoma”，利用MeRIPseq鉴定了胰腺癌细胞的超级增强子表达seRNA-m6A含量远大于正常细胞。进一步通过CUT&Tag和ATACseq...