依托先进的Protein A/G-Tn5融合蛋白体系和高通量测序平台，我们为广大科研工作者提供CUT&Tag技术分析。一、文库构建和测序流程 从DNA样品到最终数据获得，样品检测、建库、测序每一个环节都可能会对数据质量和数量产生影响，而数据质量又会直接影响后续信息分析的结果。因此，获得高质量数据是保证生物信息分析正确、全面...
是CUT&RUN的2.0版本。CUT&Tag完全颠覆传统ChIP-seq（染色质免疫沉淀-测序）的操作流程，它能够高效、...
由于CUT&Tag 背景低,即使对于人类基因组,3M 双端 150bp 测序数据足以描述组蛋白修饰和转录因子。项目执行通常测序 6G clean base。 Q4. CUT&Tag 测序是否需要设置生物学重复? 建议设置 2 个及以上的生物学重复。根据已有文献显示,CUT&Tag 生物学重复样本相关性较高,重复较好。 Q5. 没有特异性 ChIP 级一抗可...
④使用Tn5转座酶代替传统的超声打断,靶向性更强。 ChIP-seq与CUT&Tag的对比 CUT&Tag相较于ChIP-seq具有更低的背景信号 相较于ChIP-seq,CUT&Tag具有更高的样本重复性 在相同的测序数据量下,CUT&Tag的peak Region内的数据量更多,信号更强 承启生物CUT&Tag分析流程 部分CUT&Tag分析内容展示 reads相对基因位置分布...
为克服此技术瓶颈，2019年Henikoff实验室在Nature Communications上公布的CUT&Tag技术显著降低了细胞样本的起始量需求，同时在数据的信噪比、重复性以及检测灵敏度等方面取得了突破性进展。通过特异性抗体识别特定组蛋白修饰位点，结合CUT&Tag技术的高通量检测能力，科学家能够精准地绘制全基~因组范围内的组蛋白修饰图谱，...
CUT&Tag细胞起始量通常为106,诺禾致源CUT&Tag可以超低量——1000个细胞建库。 一抗:H3K4me2 细胞量:105、104、103 结果: (1)reads在TSS附近富集; (2)1000细胞起始量检出peak数目与104、105细胞数的peak检出数目相当; (3)皮尔逊相关系数大于0.95,表明不同起始量...
图5. 单细胞CUT&Tag测序流程(Henikoff,2019) Part III 翌圣CUT&Tag产品重磅上线 翌圣生物CUT&Tag试剂盒相较于传统的ChIP-seq,优化了反应体系和实验操作流程,文库时间更短(仅需7小时),起始样本要求更低,抗体投入量更少,文库产量更高等优点,是蛋白质-DNA互作研究技术的又一颠覆性创新。
CUT&Tag本身是一种高通量测序技术,zui终所获取的实验结果也是测序文库。CUT&Tag的文库与ChIP-Seq类似,都是200-1000bp左右的文库。测序所得的数据可以用常规的分析软件进行分析,无需特殊的分析软件。一般的实验流程为:细胞与磁珠结合—一抗孵育—二抗孵育—转座体孵育—片段化—DNA提取—PCR构建文库—文库纯化—质检...
CUT&Tag是Cleavage Under Targets and Tagmentation(靶向剪切及标签技术)的缩写,可以用来研究组蛋白修饰以及蛋白质与DNA之间的相互作用,该技术利用Tn5转座酶的特点,在切割染色质的同时直接插入接头(adaptor),极大地缩减了建库时间,且对样本量的要求更低,所需的测序深度也更低 (Kaya-Okur et al., 2019)。
实验数据展示: 图2. CUT&Tag®4.0 产品交联与非交联测序数据结果展示 结果表明:对于转录因子而言,利用高浓度甲醛交联处理后,实验获得的 peak 数更多,背景更低,信噪比更高。 结果表明:对同一靶位点,不同细胞起始投入量进行 CUT&Tag 文库构建;在相同细胞种类与细胞量的投入量下进行 CUT&Tag 文库构建;在相同细胞...