依托先进的Protein A/G-Tn5融合蛋白体系和高通量测序平台，我们为广大科研工作者提供CUT&Tag技术分析。一、文库构建和测序流程 从DNA样品到最终数据获得，样品检测、建库、测序每一个环节都可能会对数据质量和数量产生影响，而数据质量又会直接影响后续信息分析的结果。因此，获得高质量数据是保证生物信息分析正确、全面...
表1 CUT&Tag与ChIP-seq实验相比具有的优势 CUT&Tag在植物上的应用 2019年Kaya-Okur等人首先在哺乳动物中使用CUT&Tag技术提供了高分辨率测序来分析不同的染色质组分,通过在低样本量和单细胞水平分析组蛋白修饰、RNA聚合酶II和转录因子的表达证明了CUT&Tag技术的实用性 (Kaya-Okur et al., 2019)。这是首次运用CUT...
由于CUT&Tag 背景低,即使对于人类基因组,3M 双端 150bp 测序数据足以描述组蛋白修饰和转录因子。项目执行通常测序 6G clean base。 Q4. CUT&Tag 测序是否需要设置生物学重复? 建议设置 2 个及以上的生物学重复。根据已有文献显示,CUT&Tag 生物学重复样本相关性较高,重复较好。 Q5. 没有特异性 ChIP 级一抗可...
在探究蛋白质与DNA相互作用及组蛋白修饰机制时，传统技术ChIP-seq（Chromatin Immunoprecipitation Sequencing，染色质免疫共沉淀测序）仍存在一些局限性，如对细胞起始量要求较高、容易产生假阴性或假阳性结果、重复性较差、信噪比低等问题。为克服此技术瓶颈，2019年Henikoff实验室在Nature Communications上公布的CUT&Tag技术...
翌圣生物CUT&Tag试剂盒相较于传统的ChIP-seq,优化了反应体系和实验操作流程,文库时间更短(仅需7小时),起始样本要求更低,抗体投入量更少,文库产量更高等优点,是蛋白质-DNA互作研究技术的又一颠覆性创新。 1.更高的文库质量。 图6. 文库质检图 2.数据质量好。 图7.测序数据对比图 3.更高的信噪比 图8.信噪比...
ChIP-seq与CUT&Tag的对比 CUT&Tag相较于ChIP-seq具有更低的背景信号 相较于ChIP-seq,CUT&Tag具有更高的样本重复性 在相同的测序数据量下,CUT&Tag的peak Region内的数据量更多,信号更强 承启生物CUT&Tag分析流程 部分CUT&Tag分析内容展示 reads相对基因位置分布统计 ...
CUT&Tag本身是一种高通量测序技术,zui终所获取的实验结果也是测序文库。CUT&Tag的文库与ChIP-Seq类似,都是200-1000bp左右的文库。测序所得的数据可以用常规的分析软件进行分析,无需特殊的分析软件。一般的实验流程为:细胞与磁珠结合—一抗孵育—二抗孵育—转座体孵育—片段化—DNA提取—PCR构建文库—文库纯化—质检...
CUT&Tag细胞起始量通常为106,诺禾致源CUT&Tag可以超低量——1000个细胞建库。 一抗:H3K4me2 细胞量:105、104、103 结果: (1)reads在TSS附近富集; (2)1000细胞起始量检出peak数目与104、105细胞数的peak检出数目相当; (3)皮尔逊相关系数大于0.95,表明不同起始量...
ChIP-seq vs. CUT&RUN vs. CUT&Tag: Which should you use? 传统ChIP-seq流程,了解一下:https://github.com/hbctraining/Intro-to-ChIPseq/blob/master/schedule/2-day.md Cut&Run与ChIP-seq的核心区别 pA-Tn5的引入,增强了捕获的特异性,使得起始量需求变少,信噪比变低,需要的数据量变少。改善的信噪比意...
CUT&Tag是Cleavage Under Targets and Tagmentation(靶向剪切及标签技术)的缩写,可以用来研究组蛋白修饰以及蛋白质与DNA之间的相互作用,该技术利用Tn5转座酶的特点,在切割染色质的同时直接插入接头(adaptor),极大地缩减了建库时间,且对样本量的要求更低,所需的测序深度也更低 (Kaya-Okur et al., 2019)。