CUT&Tag是Cleavage Under Targets and Tagmentation(靶向剪切及标签技术)的缩写,可以用来研究组蛋白修饰以及蛋白质与DNA之间的相互作用,该技术利用Tn5转座酶的特点,在切割染色质的同时直接插入接头(adaptor),极大地缩减了建库时间,且对样本量的要求更低,所需的测序深度也更低 (Kaya-Okur et al., 2019)。 CUT&Tag...
图1 CUT&Tag建库原理及实验流程 CUT&Tag系列产品 ABclonal针对不同客户群体需求，提供了可灵活搭配选择的产品货架，包括CUT&Tag试剂盒, 转座体, 单酶, 以及经过验证的CUT&Tag抗体（ABclonal自产抗体）。pAG-转座酶的酶切活性 不同起始量的DNA样本加入1 μL pAG-Tn5 Transposome在55℃反应15 min，搭配 ABclonal...
1.低起始量建库 微量建库研发,可低至1000个细胞起始; 2. 低活性建库 细胞活性低至40%可稳定出库 3. 新鲜样本 针对于新鲜样本的CUT&Tag研究,推出针对短途、中途、长途不同距离的运输方案,以保证样本到达实验室的活性。 4. 分析内容丰富 除CUT&Tag标准分析内容外,诺禾致源还可提供CUT&Tag&转录组关联分析、增强...
CUT&Tag本质上是一种用来替代传统的ChIp-seq探索DNA-蛋白质互作的技术,与ChIp-seq一样,可以进行ChIP-qPCR分析或者测序后mapping分析。对于CUT&Tag实验,打断之后的片段如果不进行测序分析也可以直接qPCR,分析靶蛋白结合情况。当然,CUT&T...
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是Steven Henikoff团队于2019年基于CUT&RUN(一文搞懂CUT&RUN)进行改进的研究蛋白质与DNA相互作用的技术,该技术利用Tn5转座酶的特点,在切割染色质的同时直接插入接头(adaptor)极大地缩减了建库时间,且对样本量要求更低,所需测序深度也更低。
CUT&Tag和ChIP 技术的实验原理类似,均利用抗体与目标蛋白特异性结合来富集与之相互作用的DNA片段。CUT&Tag技术的核心是将Tn5转座酶进行改造,融合proteinA/G(形成pA/G-Tn5融合蛋白),其优点是特异性强,灵敏度高,背景噪音较低,重复性好,并且对样本要求量少。现在,CUT&Tag已成为组蛋白翻译后修饰(PTM)和从包括单细...
图1. CUT &Tag技术原理图[2] 翌圣pG-Tn5 由于CUT&Tag主要是针对极低细胞起始量进行实验,这就要求核心酶原料具有高切割活性、对微量DNA有高灵敏度和高亲和力以及超低污染性。翌圣ZymeEditor™酶改造平台将改造的具有超高活性的Tn5转座酶突变体与Protein G融合,从而获得能精准、高效切割目的蛋白附近DNA序列的pG-Tn...
Release Using Nuclease)技术,其主要原理是:细胞经过洋地黄皂苷(digitonin)透化处理后与目标抗体孵育,抗体进入细胞与目的蛋白结合;细胞再与proteinA/G-MNase孵育,加入Ca2+激活MNase,切割目的蛋白结合位点附近的染色质,被切割下来的片段扩散到上清中,从上清液中收集DNA片段,经过常规DNA建库步骤进行建库,文库上机测序(见图...
1)实验原理 CUT&Tag是蛋白质与DNA互作的革新技术,无需通过甲醛交联以及免疫共沉淀,其核心技术为pA/G-Tn5 Transposase,将Protein A/G与Tn5转座酶进行融合,使得与抗体结合的同时,Tn5切割核小体上缠绕的DNA片段,获得目的序列。 图2. CUT&Tag原理图 2)实验流程 ...