CUT&Tag ( Cleavage Under Targets and Tagmentation)技术于2019年5月由Steven Henikoff博士实验室研发并首次于Nature Communications报道[1]。相比于ChIP技术来说,CUT&Tag技术凭借原位捕获DNA与蛋白质互作的特点,建库更高效简便,信噪比更高,样本量要求更低,众多优势让其迅速成为研究DNA-蛋白质互作的新宠与热点技术,被广...
更为惊奇的是,多篇客户文章证实,CUT&Tag对RAR、CCKBR、TWIST2(转录因子)、JUN、JUNB、PIM1、Runx1、SOX15等DNA直接或者间接结合蛋白都具有很好的适用性。即CUT&Tag技术适用于全基因组范围内的DNA-蛋白质互作研究。 图4.CUT&Tag在不同靶蛋白上的应用 应用场景三: ...
更为惊奇的是,多篇客户文章证实,CUT&Tag对RAR、CCKBR、TWIST2(转录因子)、JUN、JUNB、PIM1、Runx1、SOX15等DNA直接或者间接结合蛋白都具有很好的适用性。即CUT&Tag技术适用于全基因组范围内的DNA-蛋白质互作研究。 图4.CUT&Tag在不同靶蛋白上的应用 应用场景三: CUT&Tag技术对不同的细胞样本具有广谱的适用性...
CUT&Tag是一种新的DNA—蛋白质互作研究方法。与传统的ChIP-Seq相比,CUT&Tag技术操作简便,无需免疫共沉淀和超声破碎;细胞起始量低。60-100000个细胞就可以满足需要,且CUT&Tag单细胞技术已经实现;一步完成建库,不需要传统的修复末端,加A,加接头构建文库;信噪比高。 CUT&Tag技术优势——特异性强,背景噪音较低;灵敏...
本文建立了一种敏感的G4-CUT&Tag方法，用于高分辨率和特异性的天然G4s全基因组分析。二 、材料与方法 1. 材料 （1）HEK293T细胞 （2）带有His-tag的Flag-BG4抗体 2.方法：见图1 图1 CUT&Tag实验流程 三 、实验结果 1. G4-CUT&Tag技术的信噪比及分辨率高于ChIP-seq技术 与G4 ChIP-seq相比，G4-CUT&...
CUT&Tag的实验流程更简单,所需的细胞量可以比CUT&RUN更低,CUT&Tag适用于大多数非异染色质组蛋白的研究,也适用于多数转录因子的研究,其应用场景更广。 而CUT&RUN更适用于异染色质区的组蛋白标记(H3K9me2/3)和先锋转录因子的研究。另外,由于对转录因子的分辨率更高,CUT&RUN-qPCR是传统ChIP-qPCR的理想替代者。
CUT&Tag技术优势——特异性强,背景噪音较低;灵敏度强;重复性较好;成本远低于ChIP-Seq。 CUT&Tag技术原理: CUT&Tag技术的核心是在Tn5上融合了protein A/G抗体结合功能域的转座体pAG-Tn5。在进行CUT&Tag实验时,首先进行靶蛋白特异性抗体(一抗)孵育,使抗体进入细胞与靶蛋白结合。为了放大信号,同理接着进行二抗孵...
本文建立了一种敏感的G4-CUT&Tag方法,用于高分辨率和特异性的天然G4s全基因组分析。 二、材料与方法 1. 材料 (1)HEK293T细胞 (2)带有His-tag的Flag-BG4抗体 2.方法:见图1 图1 CUT&Tag实验流程 三、实验结果 1. G4-CUT&Tag技术的信噪比及分辨率高于ChIP-seq技术 ...
接着前面,我们知道了CUT&Tag技术在不同场景下的不同应用,那么接下来一起看看CUT&Tag技术更多的拓展场景应用吧~ 一、CUT&Tag单细胞实验 实验证明,CUT&Tag细胞可以用于单细胞测序,而这是百万级细胞起始量ChIP-Seq技术所不能实现的。多篇文章表明CUT&Tag技术在单细胞测序方面有很好的应用。
CUT&Tag技术作为新一代DNA-蛋白质互作研究技术,近年来有了飞速的发展。近岸蛋白于2023年8月创新性地推出CUT&Tag®4.0专利技术,在保证组蛋白研究成功率的基础上,专门针对转录因子、辅因子等弱结合位点进行了优化升级,极大地拓展了该技...