综上所述，新建立srCUT&Tag 回收方法相比现有的CUT&Tag 产物回收方法能提高建库效率并得到更好的数据质量，为表观遗传学研究提供了更好的技术选择。关键词: CUT&Tag ；DNA 回收方法；H3K4me3；RNAPII ；CTCF ；HMGA1 Optimization of CUT&Tag product recovery and library construction method Ye Wei 1,2, Ke ...
回收或其他后处理才能进行建库PCR,不同的回收方法对CUT&Tag结果有着显著的影响.通过建立生物素化转座体-链霉亲和素磁珠体系(streptavidin beads recovery CUT&Tag,srCUT&Tag),可以快速便捷地完成CUT&Tag的产物回收.本文在K562细胞中展开H3K4me3,RNA聚合酶Ⅱ(RNA polymeraseⅡ,RNAPII),转录因子CTCF和HMGA1的CUT&Tag...
CUT&Tag中转座酶完成标签化后需要DNA回收或其他后处理才能进行建库PCR,不同的回收方法对CUT&Tag结果有着显著的影响。通过建立生物素化转座体-链霉亲和素磁珠体系(streptavidin beads recovery CUT&Tag, srCUT&Tag),可以快速便捷地完成CUT&Tag的产物回收。本文在K562细胞中展开H3K4me3、RNA聚合酶II (RNA polymerase II...
CUT&Tag产物回收和建库方法的优化 新兴的染色质靶向切割和标签化(clevage under target and tagment,CUT&Tag)技术利用转座酶在目标蛋白结合的DNA附近进行切割并对切割下的DNA片段进行标签化,通过后续的... 韦晔,卢大儒 - 《遗传》 被引量: 0发表: 2021年 基于DNA宏条形码的水体浮游细菌群落测序建库方法 新兴的...
释放后的DNA片段会结合在磁珠上,含有的SDS需要清洗干净防止其干扰PCR建库。 图5.文库质检结果,片段集中在200-500bp 呈现周期性规律 最后让我们来看一下爱基的实测数据吧: 图6. CUT&Tag酶切片段分布,转录因子/组蛋白修饰的酶切片段分布呈现周期性; 图7. reads密度分布图,reads在TSS附近呈现明显的富集; 图8. ...
本发明提供了一种甲醛重交联在CUT&Tag技术建库中的应用。本发明的方法的细胞需求量较低、测序信噪比高、操作相对简单,同时兼顾ChIP实验的甲醛重交联固定细胞的优势。特别地,ChiTag方法在探究蛋白质‑DNA弱相互作用中,具有显著优势。 法律状态 序号法律状态公告日法律状态法律状态信息 ...
近岸科技取得甲醛重交联在CUT&Tag技术建库中应用专利 金融界2025年1月7日消息，国家知识产权局信息显示，上海近岸科技有限公司取得一项名为“甲醛重交联在CUT&Tag技术建库中的应用”的专利，授权公告号CN 117051078 B，申请日期为2023年5月。天眼查资料显示，上海近岸科技有限公司，成立于2009年，位于上海市，是一家以...
针对CUT&Tag打断产物DNA提取过程中小片段丢失的问题,本试剂盒提供优化的Tagment DNA Extract Beads,相较于常规的片段分选磁珠可以完整的回收CUT&Tag产物中的小片段DNA,大大简化了酚氯仿-乙醇沉淀法的繁琐操作。此外,本试剂盒还提供了阳性抗体H3K4me3(兔抗)以及相应的二抗(羊抗兔IgG),用于阳性对照实验(仅24T规格提供阳...
CUT&Tag:CUT&Tag是研究蛋白和DNA互作新兴的实验方法,该方法是通过蛋白特异性抗体引导Protein A-Tn5酶精确切割目标蛋白结合的DNA区域,并在这些序列的两端加上测序接头,经过PCR扩增后形成可用于高通量测序的文库,随后对文库进行测序分析从而解析与目标蛋白结合的DNA片段。CUT&Tag技术可以在单个细胞水平上进行高分辨率的蛋白...
金融界2025年1月7日消息,国家知识产权局信息显示,上海近岸科技有限公司取得一项名为“甲醛重交联在CUT&Tag技术建库中的应用”的专利,授权公告号CN 117051078 B,申请日期为2023年5月。 天眼查资料显示,上海近岸科技有限公司,成立于2009年,位于上海市,是一家以从事科技推广和应用服务业为主的企业。企业注册资本1000万...