ctDNA甲基化可有效区分肝癌、肝硬化和健 康样本 一项原文发表在Nature子刊上的研究4,使用组织和液体活检早期检测和监测HCC,并提出改进的特征和风险评分,有可能用于非侵入性临床诊断。结果强调了ctDNA甲基化特征和风险评分在泛癌早期诊断、监测的潜力。 ...
一般情况下,肺癌ctDNA甲基化检测是一种通过检测血液中循环肿瘤DNA的甲基化状态来辅助诊断肺癌的新型检测方法。如果出现不适,建议及时就医。具体分析如下: ctDNA是由肿瘤细胞释放到血液中的DNA片段,携带了肿瘤细胞的基因信息,包括甲基化等表观遗传学改变。在肺癌发生发展过程中,肿瘤细胞的基因组会出现特定的甲基化变化,...
用于ctDNA甲基化标记的分析方法主要包括两种:1)基于亚硫酸氢盐(SB)处理后的PCR方法,包括甲基化特异性PCR(MSP),实时MSP(RT-MSP)和数字微滴MSP(ddMSP):亚硫酸氢盐(SB)处理后的PCR将所有非甲基化胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U),随后通过PCR转化为胸腺嘧啶(T)进行检测;2)基于...
ctDNA是游离DNA（cell-free DNA，cfDNA）中的一类，所占比例较低（甚至介于0.1%-1%之间）。基本概念之DNA甲基化 DNA甲基化是指在DNMTs的催化下，CpG岛5-胞嘧啶选择性共价结合甲基基团形成5-甲基胞嘧啶，可在细胞分裂过程中传递给子代细胞的表观遗传现象。正常细胞中CpG是非甲基化的，当其被甲基化后，甲基结合...
早筛新宠ctDNA甲基化 通过液体活检开发癌症早筛的技术最早在美国兴起,包括ctDNA、CTC和外泌体。相比传统的组织切片检测,其侵入性和副作用都要小得多,因此为癌症早筛带来了新的希望。 其中ctDNA是患者血液中游离的来自肿瘤的DNA,属于高敏感性、高特异性的肿瘤标志物。其相当于肿瘤细胞释放到血液中的“身份指纹”,...
ctDNA甲基化液体活检已经在癌症筛查、早诊、MRD监测、疗效预测及预后等方面崭露头角,然而,在其完全融入临床实践之前,还需要大量的多中心研究,以确定ctDNA甲基化检测的分析有效性和临床有效性。 参考文献 1. Kulis M, Esteller M. DNA methylation and cancer. Adv Genet. 2010;70:27-56. doi:10.1016/B978-0...
1、CSF ctDNA甲基化区域特征及其在染色体上的分布 为了确定GBM患者脑脊液(CSF)中ctDNA甲基化区域的分布和大小,作者通过ctDNA甲基化测序结果可视化分析,结果表明CSF ctDNA甲基化区域在染色体上的分布和峰值并无规律性。 2、复发性GBM患者CSF ctDNA甲基化区域特征 为了从整体上分析肿瘤样本与正常样本之间ctDNA甲基化差异...
本研究中,研究团队旨在开发一种经济有效、基于多重qPCR技术的肺癌ctDNA甲基化检测方法——LunaCAM,并评估其在肺癌早期发现和结节鉴别诊断临床实践中的应用价值。 图1 研究设计 研究人员在过往PanSeer panel的基础上,整合文献报道的肺癌差异甲基化区域 (DMR),对429例血浆样本进行甲基化分析,筛选出前50个DMRs(图2A)。
ctDNA甲基化标志物仅仅是表观遗传学应用的一个方面,技术也仅仅是研究手段,基础研究才是解决临床问题的基石,希望先进的技术可以为科研工作带来便利,也希望大家对相关研究保持客观和耐心。 参考资料: 1. Integrated digital error suppression for improved detection of circulating tumor DNA. Nature Biotechnology 2016 ...
1ng ctDNA input的WGBS文库制备获得最佳文库质量和较高基因组覆盖率,优于现有ctDNA甲基化文库构建方法 图2:Max-cap提取的高质量ctDNA和Mini-lib全基因组重亚硫酸盐测序(WGBS)制备的文库。 Max-cap从不同样本中的0.5ml(∼200μL血浆)和1mL全血中提取的ctDNA量,实验设置三个重复。