CTD数据库的数据来源主要包括科学文献、公共数据库、手工注释。科学文献是CTD数据库的主要数据来源,研究团队通过文献挖掘技术,从大量的科学文献中提取相关数据。公共数据库如NCBI、PubChem等也是CTD数据库的重要数据来源。为了确保数据的质量,CTD数据库采取了严格的质量控制措施,包括数据的手工注释和多次审核。手工注释由专...
ctd数据库筛选标准 CTD（Comparative Toxicogenomics Database）数据库是一个与毒理学和基因组学相关的数据库，用于整合和分析化合物、基因和疾病之间的关系。在CTD数据库中，你可以使用一系列的筛选标准来定位和检索相关信息。以下是一些常见的CTD数据库筛选标准：1. 毒性类型（Toxicity Type）：可以选择特定的毒性类型，...
CTD数据库,全称Comparative Toxicogenomics Database,比较毒理基因组学数据库。CTD是一个公开可用的数据库,研究基于化学药品、基因、表型、疾病和环境之间的关联,可以促进人们对化学药物和人类健康的了解。 数据库收录数据类型众多,包括超过230万种化学药物,46689个基因,4340个表型和7212种疾病的基因、化学表型,药物相关疾...
公共比较毒理基因组学数据库(CTD,http://ctdbase.org/)是一个创新的数字生态系统,它将化学品、基因、表型、疾病和暴露的毒理学信息联系起来,以促进对人类健康的了解。整合了基于文献、人工策划的交互,以创建一个知识库,协调跨物种异质数据的化学暴露及其生物影响。在这...
使用CTD数据库的一般步骤包括: 1. 访问网站:首先访问CTD数据库官方网站,这是查询和下载数据的主要平台。 2. 简单搜索: 在主页顶部的搜索框中输入关键词,如化学物质名称、疾病名称或基因名称,进行快速检索。 可以通过下拉菜单选择搜索类型,比如“Chemicals and Diseases”、“Chemicals and Genes”等。 3. 高级搜索与...
许多疾病都与环境因子和基因的相互作用有关,CTD实验室的研究人员整合了来自各种生物的关键数据(例如基因序列、化合物和比较参考),这就是CTD数据库的前身。 CTD(The Comparative Toxicogenomics Database)提供了有关化学暴露(环境和药物),基因和蛋白质,表型和疾病之间复杂相互作用的信息。这些数据与功能和途径数据集成在...
CTD数据库覆盖广泛的疾病类型，包括肿瘤、常见病和罕见病，研究样本不仅限于组织血液，还包括多种细胞系和外泌体等。对于需要深入研究疾病与环境因素相互作用的科研人员来说，CTD数据库是一个功能强大、易于使用的研究工具。引用：Davis AP, Grondin CJ, Johnson RJ, Sciaky D, Wiegers J, Wiegers TC,...
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除了直接分析微生物组数据或联合转录组数据分析肿瘤微生物与肿瘤免疫的串扰关系,还有一种迂回策略,也能与将细菌和肿瘤关联起来,那就是可以基于细菌脂多糖(LPS)相关基因进行分析,基因集合来自比较毒物基因组学数据库(CTD)(ps:CTD主要收集了化学物质与健康或疾病相关的暴露和效应关系,并以基因、蛋白、代谢等方面的生物学...
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