目前可用的CRISPR基因组编辑技术主要包括CRISPR-Cas9、CRISPR-Cas12a、碱基编辑、先导编辑、转录调控、RNA编辑,这为基因组编辑提供了更具针对性的方法,特定技术特别适合某些类型的编辑或递送模式。但虽然这些基因组编辑工具包的新增内容对解决与规范化CRISPR基...
于是,研究者采用全基因组CRISPR干扰(CRISPRi)技术确定了对51个调节AUR抗药性和61个调节AUR敏感性的基因(图2B),其亚细胞定位显示线粒体和细胞核分别是调节AUR抵抗力和敏感性的中心位置(图2C和D)。通过整合CRISPRi结果与半胱氨酸反应性评分,研究者推测CHK1可能参与了细胞核ROS的感应和反应,从而调节癌细胞对AUR的敏...
CRISPR/Cas(clustered regularly interspaced short palindromic repeats-CRISPR associated proteins)系统来源于细菌和古细菌的适应性免疫系统,是近年来被广泛应用于基因组编辑的一项新兴技术。目前,CRISPR系统已被大量挖掘,其中Ⅱ类CRISPR/Cas9作为基因组编辑工具已被广泛应用于微生物、植物和动物。除了CRISPR/Cas9,同属于Ⅱ类...
利用CRISPR/Cas9全基因组敲除技术筛选在稳态细胞密度下抑制分裂增殖的基因 紧接着,研究人员在4000万个上皮细胞中进行了CRISPR/Cas9全基因组敲除筛选,并通过上述这种强大的检测方法选择那些在低密度下正常增殖但在高密度下继续分裂的细胞。他们惊奇地发现,TRAF3的缺失会激活增殖信号通路,进而推动细胞的分裂。 TRAF3基...
目前研究较深入并广泛应用于基因组编辑技术的是来自化脓性链球菌的Ⅱ-A型SpyCas9蛋白,标志基因cas9编码Cas9效应蛋白。CRISPR/Cas9系统通过RNA指导的蛋白质复合物对外来的线性化与超卷曲的质粒均可以进行切割。 1 CRISPR/Cas9基因座 一个经典的CRISPR/Cas9基因座包含cas...
通过CRISPR修饰细胞的全基因组测序表明,脱靶会导致没有可检测到的突变。在处理单细胞克隆时,Dempster等人指出,“克隆异质性可能比核酸酶介导的脱靶效应更严重地阻碍了真正同基因细胞系的产生”。 此外,使用全基因组文库的数百个遗传筛选的大规模数据集显示出靶向同一基因的不同序列之间的高度一致性,这表明在这些测定中...
利用新算法,团队在包含80亿个蛋白质和1020万个CRISPR阵列的宏基因组数据库中搜索罕见的CRISPR系统,发现了188个以前未知的CRISPR相关基因,同时鉴定并表征了一类新的包含CRISPR系统的Cas-14(即VII型),其作用于RNA。此次新发现的系统十分罕见。研究人员表示,这种先前未知的Cas基因和CRISPR系统的发现,极大地扩展了...
CRISPR-Cas适应性免疫系统从入侵的可移动遗传元件中捕获DNA片段,并将其整合到宿主基因组中,为RNA引导免疫提供模板。CRISPR系统通过区分自身和非自身来维持基因组完整性并避免自身免疫,这一过程中CRISPR/ Cas1-Cas2整合酶是必要的,但不是充分的。2023年6月14日,加州大学伯克利分校Jennifer A. Doudna团队在Nature ...
2024 年 2 月,苏黎世大学的研究人员在Cell期刊发表了题为:Past, present, and future of CRISPR genome editing technologies(CRISPR 基因组编辑技术的过去、现在和未来)的综述论文。 基因组编辑已经成为生命科学和人类医学的变革性力量,提供了前所未有的机会来剖析复杂的生物过程和从根本上治疗遗传疾病。基于 CRISPR ...
全基因组CRISPR/Cas9高通量筛选人体细胞中的功能基因组学 (Genome-Wide CRISPR/Cas9 Screening for High-Throughput Functional Genomics in Human Cells) 简单说就是利用CRISPR/Cas9技术对人类的基因组(23对染色体上的全部基因,大约两万个)进行筛查,看看这些基因到底有哪些功能。