综上所述，研究人员使用CRISPRi筛选技术结合了无偏的基因组范围筛选和功能性分析，在BPDCN（浆细胞样树突细胞肿瘤）和其他急性白血病（包括AML和ALL）的高风险亚群中，发现了对PI3Kγ复合体的选择依赖性，揭示p21 (RAC1) 激活激酶1 (PAK1) 作为PI3Kγ的一个非典型底物，为急性白血病提供了新的治疗靶点。原文链接：...
在本研究中研究人员使用CRISPR干扰(CRISPRi)筛选技术结合无偏的基因组范围筛选和功能性分析,在BPDCN细胞系中进行基因依赖性筛选,确定p21 (RAC1) 激活激酶1 (PAK1) 作为非典型磷脂酰肌醇3激酶γ(PI3Kγ)信号通路的一个非典型底物介导细胞内在的依赖性,有望通过PAK1抑制剂来抑制其磷酸化,减少对淋巴瘤中PI3Kγ抑制剂...
功能性确认的CRE-基因联系:通过在特定的细胞类型(如K562细胞)中进行大规模的CRISPRi筛选,研究人员能够识别并确认CRE与特定基因之间的直接联系。 设计和分析的技术建议:根据对不同CRISPR筛选方法的比较和分析,研究提供了针对如何设计和执行CRIS...
中国科学院天津工业生物技术研究所王钰研究员与德国比勒费尔德大学(Bielefeld University)Volker F. Wendisch教授等在Engineering Microbiology上发表了标题为“Genome-scale CRISPRi screening: A powerful tool in engineering microbiology”的综述论文,...
通过CRISPRi筛选，研究人员鉴定了影响神经元存活的重要分子机制。GSK3β抑制了NRF2对神经活动引发的氧化应激的反应，这对理解神经元如何应对环境压力具有重要意义。APOE4型星形胶质细胞不仅促进了神经元的过度活跃，还增加了神经元的脆弱性，强调了APOE4在神经退行性疾病中的潜在作用。为神经科学领域提供了重要的工具和...
通过在人源神经元中进行 CRISPRi 筛选,研究人员确定受体型酪氨酸蛋白磷酸酶 S(PTPσ)是聚甘氨酸 - 精氨酸(poly-GR)介导的毒性的强调节因子。研究表明,降低 PTPσ 水平可通过提高 PI3P 水平,促进表达 poly-GR 和聚脯氨酸 - 精氨酸(poly-PR)的神经元存活,同时恢复早期内体和溶酶体功能。值得注意的是,敲低或...
功能性确认的CRE-基因联系: 通过在特定的细胞类型(如K562细胞)中进行大规模的CRISPRi筛选,研究人员能够识别并确认CRE与特定基因之间的直接联系。 设计和分析的技术建议: 根据对不同CRISPR筛选方法的比较和分析,研究提供了针对如何设计和执行CRISPRi筛选的技术建议,以及如何解析结果以加速非编码基因组的功能性特征研究。
一、CRISPRi筛选可以识别影响侵袭的lncRNA 研究人员使用了CRISPRi进行基因敲除，以筛选和鉴定影响体外胶质瘤细胞侵袭的lncRNA。他们通过将U87特异性 CRISPRi 文库包装到慢病毒中，并转导到稳定表达 dCas9-KRAB 的 U87 细胞中，从中筛选获得1000 倍覆盖率的sgRNA。使用嘌呤霉素筛选感染细胞，并将其接种到 Matrigel ...
最近,美国南加州大学凯克医学院研究员在PLOS GENETICS杂志上发表关于筛选调节胶质母细胞瘤的长链非编码RNA的最新成果“CRISPRi screen of long non-coding RNAs identifies LINC03045 regulating glioblastomainvasion”。编码基因是胶质母细胞瘤(GBM)的侵袭研究的主要对象,但是长链非编码RNAs(lncRNAs)由于表现出高度的细胞类...
2025年1月14日,加州大学旧金山分校Martin Kampmann在Neuron杂志发表研究论文“CRISPRi-based screens iniAssembloidsto elucidate neuron-glia interactions”,提出在iAssembloids中进行基于CRISPR干扰的筛选以阐明神经元与神经胶质细胞的相互作用。 人类大脑的复杂性使得理解其功能背后的分子机制颇具挑战。全基因组关联研究已经...