我将CRISPR-Cas13系统的应用分为3大类: (1)核酸检测。CRISPR-Cas13系统与crRNA、底物结合形成三元复合体后,Cas13蛋白被激活,此时Cas13蛋白不仅能切割底物RNA,还能切割游离在环境内的任意单链RNA,这个现象被称为旁切活性(collateral cleavage)。熟知Cas12家族的读者应该并不陌生,因为Cas12家族也
第一类CRISPR-Cas系统可以靶向DNA和RNA,根据不同的效应复合物又分为三种类型和十六种亚型。 第二类CRISPR-Cas系统的效应子模块由单个大的多结构域蛋白组成,通常包括Cas9、Cas12、Cas13等蛋白,以及crRNA或sgRNA(单链引导RNA)等RNA分子。第二类CRISPR-Cas系统主要靶向DNA,根据不同的效应蛋白又分为三种类型和十七种亚型...
Makarova等[11]基于系统发育、基因组和结构分析的证据将现有的CRISPR/Cas系统分为Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型,大多数的CRISPR/Cas系统可归于3个类型之中,其余暂时无法分类的命名为U型,并将之前发现的部分基因进行了重新分类命名,如将I-C中的cmx5重命名为Cas5,cmx6重命名为Cas...
Barrangou也是CRISPR Journal期刊的主编。 CRISPR/Cas系统类型分布图,图片来自CRISPR Journal, doi:10.1089/crispr.2017.0022。 在这项研究中,这些研究人员利用CRISPRdisco对来自美国国家生物信息技术中心参考序列数据库(NCBI RefSeq database)的2777个完整基因组进行分析,从中鉴定潜在的CRISPR-Cas系统,并对它们进行分类。他们...