在 scATAC-seq 的研究领域,数据生成和分析方法的多样性如同杂乱的拼图,使得在比较不同细胞类型或实验的染色质可及性数据时,难以得出一致的结论。 为了充分展示基于峰的分析方法存在的技术和方法学局限,研究人员选取了两个来自人类 PBMC 的独立 ATAC 数据集以及一个小鼠皮层数据集展开深入分析。其中,10× Multiome ...
H20To10μ1 ; ③VASA-Cre表达载体构建: 利用4300bp猪源VASA转录起始位点上游序列驱动Cre重组酶表达的表达载体是通过 替换实验室保存的诱导性表达Cre重组酶载体pET28a-Mxl-Cre-BGHpolyA-FRT2neo中Mxl 序列完成的,构建载体为pET28a-VASA-Cre-BGHpolyA-FRT2neo,基因序列SEQIDN0:1,命 名为:VASA-Cre,载体全长:12,...
15、seq id no.3: 16、gagcttacattgtacgctgccctggctgtcgacgatgccgcacagcagatgtgaaagctattttttgtttaagattaaactttttctggtgctgggaaatcttaacttgttaacctttaaattgtagataggatgcacaacgatccagatttatgtgaagtttagaagcctcaagctgtgaggcccagggctgaggaataaagtaaatagaatttggagtatgtacgttctaatttccagaaatttgtaataaaagcatttttgttagctcgact...
所述pAcmv-stop-EGFP的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.1所示。 一种Cre融合蛋白功能检测细胞,宿主细胞为HEK293细胞,将pAcmv-stop-EGFP载体和phiC31整合酶表达载体pCMVint共转染宿主细胞;利用G418抗性筛选阳性转染的重组细胞,并筛选其中attB-CMV-stop-EGFP表达载体以单拷贝的形式整合入宿主细胞假attP位点的细胞。 所述的Cre...
实施例1 定点打靶载体的构建(A)pBC-LoxP打靶载体的制备pBC-LoxP打靶载体的示意如图2A所示,其中各元件的具体序列如SEQ IDNO1-5所示。 1.各部分元件的来源1)本地山羊β-酪蛋白同源臂根据GENBANK gi15425979报道的序列设计并合成如下引物BCZ5’sTTCACGCAAAGATGGGCAC(SEQ ID NO6)和BC-PcGTCTTGGATTGCTTAGAAAACCC(SE...
单细胞RNA+单细胞ATAC测序助力解析小鼠不同器官γ δ T细胞异质性图谱 Single-cell RNA-seq and chromatin accessibility profiling decipher the heterogeneity of mouse γδ T cells 发表期刊:Science Bulletin 影响因子:11.78 文章概述:γδ T细胞具有重要的免疫监视功能,其不同亚型在维持组织稳态和局部免疫反应中发挥...
1.一种Cre和Flp依赖的逆向示踪重组伪狂犬病毒的制备方法,包括下述步骤:1)Cre和Flp依赖表达绿色荧光蛋白和红色荧光蛋白的质粒构建:采用PCR扩增、酶切重组的方式将SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO.16所示序列顺次插入载体pAAV-nEF Con/Fon hChR2(H134R)-EYFP,获得克隆...
[0040] gtattgatga atatactcct gctgactctt cctggacagc agaagtctca ggaccaccaa 1800 [0041] tcctcccagg atatacgacc caatctagat ggtttggacc tggagtgaca gcagagacca 18608序 列表 [0042] agccaatcat attggaagag ttggctagtg tcttgcagca gatcggaatc aagctgattt 1920 ...
Adipocyte-specific ATAC-seq with adipose tissues using fluorescence-activated nucleus sorting J Vis Exp, 193 (2023) Google Scholar [26] H.C. Roh, L.T.Y. Tsai, M. Shao, D. Tenen, Y. Shen, M. Kumari, et al. Warming induces significant reprogramming of beige, but not Brown, adipocyte...
专利摘要:Cre重组酶重组基因及CreloxP介导的转基因安全性植物表达载体,它涉及一种Cre重组酶重组基因及植物表达载体。它解决了现有CreloxP位点特异性重组系统去除转基因植物中标记基因的方法中因CreloxP位点特异性重组系统具有可逆性,导致其删除效率降低的问题。crein基因序列如SEQ ID NO:1所示。本发明载体包含标记基因bar...