CpG island CpG岛(CpGisland):CpG双核苷酸在人类基因组中的分布很不均一,而在基因组的某些区段,CpG保持或高于正常概率,这些区段被称作CpG岛,在哺乳动物基因组中的1~2kb的DNA片段,它富含非甲基化的CpG双倍体。CpG岛主要位于基因的启动子和第一外显子区域,约有60%以上基因的启动子含有CpG岛。GC含量大于50...
百度试题 题目[名词解释] CpG island 相关知识点: 试题来源: 解析 是DNA上的一个区域,富含GC,两者以磷酸酯键相连,长度约几百到几千bp不等,常出现在管家基因或频繁表达的基因的启动子附近,在这些部位,CpG岛具有阻止序列甲基化的作用。反馈 收藏
CpG岛(CG island):也称为HTF岛,是一些富含GC的小区域,定义为Y值(观测到的CpG双碱基数与预期的数目之比)并且含量大于50%的序列区域,它可以有几百bp到几千bp长。通常出现在管家基因(housekeeping gene)或频繁表达基因的启动子周围。 EMBL提供的工具:CpGPlot、CpGReport、Isochore。相关知识点: 试题...
CpG岛岸(CpG island shore) 20多年前首先发现DNA异常甲基化与癌症相关,并将肿瘤抑制基因高甲基化和癌基因的低甲基化与肿瘤发生联系起来,但这些研究多数仅限于分析启动子和CpG岛(CpG islands CGIs)甲基化的改变。然而积累的资料表明,上述DNA甲基化的改变,并不总是疾病特异性的。随着下一代测序等新技术的开发,有...
然而积累的资料表明,上述DNA甲基化的改变,并不总是疾病特异性的。随着下一代测序等新技术的开发,有可能进行无偏的、全基因组DNA甲基化(甲基化组)分析。近来在单核苷酸分辨水平鉴定人DNA甲基化组,发现了CpG岛岸(或译成岛滩 CpG island shore)现象,这是甲基化组研究的重要进展[1-3]。
It marks bases meeting this criteria within a moving window of 100 DNA bases and then returns the results in cpgStruct, a MATLAB structure containing the starting and ending bases of the CpG islands greater than the minimum island size of 200 bases. cpgStruct = cpgisland(SeqDNA, ...'...
[名词解释] CpG island (CpG 岛) 相关知识点: 试题来源: 解析 基因组中长度为300~3000bp的富含CpG二核苷酸的一些区域,主要存在于基因的5′区域。启动子区中CpG岛的未甲基化状态是基因转录所必需的,而CpG序列中的C的甲基化可导致基因转录被抑制。反馈 收藏 ...
题目CpG island (CpG 岛) 相关知识点: 试题来源: 解析 基因组中长度为300~3000bp的富含CpG二核苷酸的一些区域,主要存在于基因的5′区域。启动子区中CpG岛的未甲基化状态是基因转录所必需的,而CpG序列中的C的甲基化可导致基因转录被抑制。反馈 收藏
CpG island chromatin: A platform for gene regulation. Epigenetics. 2011;6(2):147–52.Blackledge NP, Klose R (2011) CpG island chromatin: a platform for gene regulation. Epigenetics 6(2):147–152 CentralBlackledge NP, Klose R (2011) CpG island chromatin: a platform for gene regulation. ...