CpG岛岸(CpG island shore) 20多年前首先发现DNA异常甲基化与癌症相关,并将肿瘤抑制基因高甲基化和癌基因的低甲基化与肿瘤发生联系起来,但这些研究多数仅限于分析启动子和CpG岛(CpG islands CGIs)甲基化的改变。然而积累的资料表明,上述DNA甲基化的改变,并不总是疾病特异性的。随着下一代测序等新技术的开发,有...
必应词典为您提供cpgislands的释义,网络释义: 岛;胞嘧啶和鸟嘌呤二核苷酸;
CpG岛分析工具(CpG Islands)- SMS2南京德泰生物镜像 CpG岛分析工具用于分析CpG岛的潜在区域,分析算法请参考文献Gardiner-Garden and Frommer (1987)。算法采用大小为200bp、步长为1的滑动窗口进行计算。CpG岛是Obs/Exp值大于60%,GC含量大于50%的一段序列。期望值(Exp)=‘C’的出现次数 * ‘G’的出现次数 / 滑...
CpG Shores指的是位于CpG island上下游2kb 以内的区域;CpG Shelves指的是位于CpG shores上下游2kb以内的区域;open sea指的是CpG islands,CpG shores,CpG shelves之外的其他区域。 可以看到,位于open sea的探针是最多的。
CpG islands (CGIs) have evolved from a peculiar sequence overrepresentation of CpGs to being recognized as functionally important parts of the genome that define and regulate promoter regions of vertebrates. CGIs have been resistant to a unified mathematical definition, but recent approaches are ...
在甲基化芯片中,对于CpG位点所在的区域,会有对应的注释信息,比如CpG islands。CpG island是基因组上一段CpG位点密度较高的区域,这个概念是非常常见的 ,出了CpG island 之外,还会有CpG shores, CpG shelves, open sea等情况,这些区域又是如何定义的呢? 有一篇文章详细评估了 450K芯片所检测的CpG位点在人类基因组...
求翻译:CpG–islands是什么意思?待解决 悬赏分:1 - 离问题结束还有 CpG–islands问题补充:匿名 2013-05-23 12:21:38 的CpG岛 匿名 2013-05-23 12:23:18 CpG海岛 匿名 2013-05-23 12:24:58 CpG海岛 匿名 2013-05-23 12:26:38 CpG 岛—— 匿名 2013-05-23 12:28:18 CpG 岛...
CpG shores等概念是根据与CpG island的距离进行定义的。 CpG Shores指的是位于CpG island上下游2kb 以内的区域;CpG Shelves指的是位于CpG shores上下游2kb以内的区域;open sea指的是CpG islands,CpG shores,CpG shelves之外的其他区域。 可以看到,位于open sea的探针是最多的。
CpG岛主要位于基因的启动子(promotor)和外显子区域,是富含CpG二核苷酸的一些区域,长度为300—3000bp。这里CpG是胞嘧啶(C)—磷酸(p)—鸟嘌呤(G)的缩写。在哺乳动物中CpG以两种形式存在:一种是分散于DNA序列中;另一种呈现高度聚集状态,人们称之为CpG岛(CpG island)。在正常组织里,70%～90%散在的CpG是被甲基...
CpG Islands reports potential CpG island regions using the method described byGardiner-Garden and Frommer (1987). The calculation is performed using a 200 bp window moving across the sequence at 1 bp intervals. CpG islands are defined as sequence ranges where the Obs/Exp value is greater than ...