（2）GFN1-xTB，冻结晶体底部3层原子；（3）PBE-D3(BJ)/DZVP-MOLOPT-SR-GTH，冻结晶体底部3层...
按照视频建模完毕后,保存成gjf文件,就是此文文件包里的graphite_oxide_H2O.gjf,可见里面有Tv(平移矢量)信息。 此例的计算将使用PBE-D3(BJ)/TZVP-MOLOPT-GTH完成。由于当前体系有弱相互作用,所以加了DFT-D3(BJ)校正,相关知识见《谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”》(http://sobereva.com/413)。 启...
首先用GFN1-xTB进行预优化，得到的结构正常，再用PBE-D3（BJ）和DZVP-MOLOPT-SR-GTH进行进一步优化，...
4、设置理论方法,我们选择PBE泛函,在1选项中默认为PBE泛函,保持默认方法;除PBE方法之外,cp2k还支持设置其他的方法,包括一些杂化泛函,具体见下图: 5、选择3设置色散校正处理弱相互作用,对常用的PBE泛函有D3和D3(BJ)两种选择,自行查阅文献明确色散校正对计算结果可能的影响。如无特殊理由,一般建议加上。 6、Cu金属...
本文文件包里的opt目录下的NaCl_CO-1.restart是CP2K在PBE-D3(BJ)/DZVP-MOLOPT-SR-GTH级别下对这个体系做优化产生的restart文件,我们将基于这个结构绘制密度差。为简化问题,在优化的时候整个NaCl板的坐标被冻结为了晶体坐标的状态,因此不涉及表面重构。
经常使用的泛函有LDA(PADE), BLYP以及PBE,在CP2K的tests目录中有相应的优化基组. 此外, CP2K中也可以使用B3LYP、HSE等杂化泛函, 可以使用DFT-D3 等色散校正 通过DFT-D2以及DFT-D3模型进行色散矫正 DFT+U 线性标度Kohn-Sham矩阵计算的稀疏矩阵和预筛选技术 DIIS自洽场极小化 通过TDDFPT计算激发态 CP2K中...
3.1.3 基组和泛函 CP2K中可以使用的泛函很多,但并非每个基组都为相应的泛函进行了优化。经常使用的泛函有LDA(PADE),BLYP以及PBE,在CP2K的tests目录中有相应的优化基组。此外,CP2K中也可以使用B3LYP、HSE等杂化泛函,可以使用DFT-D3等色散校正。在CP2K中使用B3LYP泛函时,关键输入文件如下: ...
3.1.3 基组和泛函 CP2K中可以使用的泛函很多,但并非每个基组都为相应的泛函进行了优化。经常使用的泛函有LDA(PADE),BLYP以及PBE,在CP2K的tests目录中有相应的优化基组。此外,CP2K中也可以使用B3LYP、HSE等杂化泛函,可以使用DFT-D3等色散校正。在CP2K中使用B3LYP泛函时,关键输入文件如下: ...
&END PBE &END XC_FUNCTIONAL &vdW_POTENTIAL DISPERSION_FUNCTIONAL PAIR_POTENTIAL &PAIR_POTENTIAL TYPE DFTD3 PARAMETER_FILE_NAME dftd3.dat REFERENCE_FUNCTIONAL PBE &END PAIR_POTENTIAL &END vdW_POTENTIAL &END XC &END DFT &SUBSYS &TOPOLOGY ...
&END PBE &END XC_FUNCTIONAL &vdW_POTENTIAL DISPERSION_FUNCTIONAL PAIR_POTENTIAL &PAIR_POTENTIAL TYPE DFTD3 PARAMETER_FILE_NAME dftd3.dat REFERENCE_FUNCTIONAL PBE &END PAIR_POTENTIAL &END vdW_POTENTIAL &END XC &END DFT &SUBSYS &TOPOLOGY ...