cp2k@2023.1 %aocc ^amdfftw ^amdscalapack ^amdblis ^amdlibflame ^libint ^openmpi fabrics=cma,ucx # Example: For building CP2K 2023.1 with ELPA, AOCC and AOCL $ spack install cp2k@2023.1+elpa %aocc ^amdfftw ^amdscalapack ^amdblis ^amdlibflame ^elpa+openmp ^libint ^openmpi fabrics=cma...
首先尝试了openmpi编译cp2k-2024.1，在i7-12700k的工作站上编译可正常运行，但在8375C工作站上单核...
根据Sobevera老师的说法，Gromacs若不是需要跨节点运行无需编译OpenMPI版，效率可能还会有下降。我在Cmake...
并行工具只需要安装一个即可，OpenMPI是更普遍的选择，如果之前安装过任意并行工具，且任意并行工具在环境...
如果你的服务器上最初没有安装并行工具,也可以使用--with-openmpi=install或者--with-mpich=install让toolchain自动安装(笔者机器事先安装了OpenMPI 4.0.3)。 (2) 读者可以通过添加“--math-mode=mkl --with-scalapack=no”来让CP2K调用MKL数学库。据说使用intel MKL库的计算速度会比默认的调用openblas和scalapack...
OpenMPI 可选用 CP2K 默认构建的,也可自行编译。我这里考虑到其他软件(ORCA)对 OpenMPI 4.1.1 版本有明确需求,故采用自行编译的 OpenMPI。 sudo dnf install gcc gcc-gfortran wget https://download.open-mpi.org/release/open-mpi/v4.1/openmpi-4.1.1.tar.bz2 tar -xf openmpi-4.1.1.tar.bz2 ./configure...
第三步:./install_cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=install --with-plumed=install --with-gcc=install。终端输入该命令,编译部署工具链。结束后显示y以下内容表示操作成功,并根据以下提示进行后续操作: === usage === Done! Now copy: cp /home/user/software/cp2k-2024.1/tools/toolch...
输入:export PATH=/xxxxx/openmpi-build/bin:$PATH.(xxxxx/openmpi-) 打开终端输入mpicc -show,应该会显示是用 gnu9.3编译的mpicc。 到这里我们就搞完了所有cp2k需要的配置。 接下安装cp2k,教程参考清华大学刘锦程博士的视频https://www.bilibili.com/video/BV1Y54y1e7Yx?from=search&;seid=16406313280551908313 ...
1./configure --prefix=/opt/openmpi-1.6.5F77=ifort FC=ifort23make45make install 注意,make install时需要root权限。 从http://sourceforge.net/projects/cp2k/files 下载CP2K 2.5.1的源码,解压缩,修改arch目录中的Linux-x86-64-intel.popt文件如下 : ...
根据CPU支持的指令集，选择自行编译FFTW库，并添加enableavx2选项以加速模拟过程。安装OpenMPI：可以使用CP2K默认构建的版本或自行编译OpenMPI，确保兼容性与所需版本满足其他软件需求。安装CP2K：根据Gromacs编译时给出的额外参数选择安装组件。使用toolchain进行安装，确保安装过程中选择正确的组件和参数。若cosma...