显然可以 仔细看 谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正？”http://sobereva.com/413 下文介绍的...
通过DFT-D2以及DFT-D3模型进行色散矫正 DFT+U 线性标度Kohn-Sham矩阵计算的稀疏矩阵和预筛选技术 DIIS自洽场极小化 通过TDDFPT计算激发态 CP2K中主要有两种SCF的收敛算法, 一种是基于轨道变换(OT)的算法, 一种是基于对角化(DIAG)的算法. 如果体系有较大带隙的, 如为半导体或者绝缘体等, 推荐使用OT算法, ...
使用DFT-D3(BJ)色散校正,并开启OT。 使用16个核心来计算该任务。 export OMP_NUM_THREADS=16 cp2k.ssmp -i init.inp -o init.out 获得优化后的复合物结构。 1. 体系平衡 将上一步获得的pdb文件最后一帧另存为opt.pdb文件,准备进行平衡相模拟,以使体系达到预平衡。 使用Multiwfn载入opt.pdb,输入如下内容:...
TYPE DFTD3 REFERENCE_FUNCTIONAL PBE #R_CUTOFF [angstrom] 16 &END PAIR_POTENTIAL &END VDW_...
3.1.3 基组和泛函 CP2K中可以使用的泛函很多,但并非每个基组都为相应的泛函进行了优化。经常使用的泛函有LDA(PADE),BLYP以及PBE,在CP2K的tests目录中有相应的优化基组。此外,CP2K中也可以使用B3LYP、HSE等杂化泛函,可以使用DFT-D3等色散校正。在CP2K中使用B3LYP泛函时,关键输入文件如下: ...
MINIMIZER DIIS &END OT &PRINT &RESTART OFF &END RESTART &END PRINT &END SCF &XC &XC_FUNCTIONAL PBE &PBE PARAMETRIZATION REVPBE &END PBE &END XC_FUNCTIONAL &vdW_POTENTIAL DISPERSION_FUNCTIONAL PAIR_POTENTIAL &PAIR_POTENTIAL TYPE DFTD3 ...
3 输入要产生的CP2K输入文件的路径 4 通过各种选项设置如何进行计算 5 选择0,得到CP2K输入文件 下面第2节先说载入到Multiwfn的输入文件的要求。第3节给出一些例子演示产生CP2K输入文件的过程。Multiwfn的这个功能始终不断打磨并且迎合CP2K最新版本的改变,本文内容对应Multiwfn官网上最新版本的Multiwfn(不是今天刚下载的...
本文例子中周期性体系的DFT计算部分使用CP2K 8.1版实现,安装方法见《CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法》(http://sobereva.com/586)。CP2K结合Multiwfn可以非常容易地使用,见《使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件》(http://sobereva.com/587)。本文绘图使用VMD 1.9.3版,可以在http://www.ks...
范德华校正方法,DFT-D3的设定,SCAN+rVV10设定,DFT+U处理强相关体系,HSE06杂化泛函的计算。铁磁,反铁磁,亚铁磁等磁性体系初始磁矩的设定。 晶胞优化,几何结构优化,频率计算 CELL_OPT和GEO_OPT设置与计算技巧,分子体系优化,固体和表面体系结构优化,吸附分子体系的优化,静态频率计算,自由能等热力学量的校正。非...
讲解如何正确加DFT-D3、DFT-D4和rVV10色散校正,怎么计算原子受力,如何在计算时加外电场和外电势。 • 半经验级别的计算:介绍GFN-xTB方法的特点以及能量表达式细节,讲解GFN1-xTB和GFN0-xTB在CP2K中的使用,给出CP2K做这两种方法计算MIL125 2*2*2超胞(1920个原子)的例子使得学员充分领略到GFN1-xTB和GFN0-...