读者也可以将“--with-plumed=system“改成“--with-plumed=install”,这样toolchain会自动安装PLUMED(你就不需要事先安装了), 但toolchain安装的PLUMED (V2.6.2)不是最新版本,不能满足笔者的计算需求,所以笔者采用了事先安装好的PLUMED(V2.7.1)(后续笔者会跟大家分享PLUMED的安装及使用)。 这一步通常需要运行很...
cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=install --with-plumed=install时候，安装plumed...
./install_cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=install--with-plumed=install --...
第二步:cd /home/user/software/cp2k-2024.1/tools/toolchain。进入解压后的目录tools/toolchain/(全路径为:/home/user/software/cp2k-2024.1/tools/toolchain)。 第三步:./install_cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=install --with-plumed=install --with-gcc=install。终端输入该命令,编译...
按照上文安装步骤,只需要修改Installprerequisites中的: ./install_cp2k_toolchain.sh --with-openmpi=system --with-plumed=system 修改Compile: make -j 16 ARCH=local VERSION="ssmp psmp" 这样就 OK 了,实现 CP2K 和 PLUMED 联动,也可以用 psmp: MPI+OpenMP混合并行,可以单机并行也可以跨节点并行。
一步完成所有插件编译,没有任何报错。 plumed=installMPIis detected and it appears to be OpenMPI Compilingwith56processes.===FindingGCCfromsystem paths===path to gcc is/usr/bin/gcc path to g++is/usr/bin/g++path to gfortran is/usr/bin/gfortran Found include directory/usr/include Step gcc ...
一步完成所有插件编译,没有任何报错。 plumed=installMPIisdetectedanditappearstobeOpenMPICompilingwith56processes.===FindingGCCfromsystempaths===pathtogccis/usr/bin/gccpathtog++is/usr/bin/g++pathtogfortranis/usr/bin/gfortranFoundincludedirectory/usr/includeStepgcctook0.00seconds.===Gettingprocarchinfousing...
cp2k安装 # 下载链接 https://github.com/cp2k/cp2k/releases 注:tar.gz安装包make文件有问题$ tar -xf cp2k-2022.1.tar.bz2 $cdcp2k-2022.1/tools/toolchain $ ./install_cp2k_toolchain.sh -h 查看安装参数 $ ./install_cp2k_toolchain.sh --with-intel --with-intelmpi --with-plumed# 在脚本执...
cp2k安装 # 下载链接 https://github.com/cp2k/cp2k/releases 注:tar.gz安装包make文件有问题$ tar -xf cp2k-2022.1.tar.bz2$ cd cp2k-2022.1/tools/toolchain$ ./install_cp2k_toolchain.sh -h 查看安装参数 $ ./install_cp2k_toolchain.sh --with-intel --with-intelmpi --with-plumed# 在脚本执...
(a) 将./install_cp2k_toolchain.sh 一行修改为:./install_cp2k_toolchain.sh --with-openblas=no --with-scalapack=no --with-ptscotch=no --with-superlu=no --with-pexsi=no --with-quip=no --with-plumed=no --with-acml=no --with-spfft=no --with-gsl=no --with-hdf5=no --with-lib...