读者也可以将“--with-plumed=system“改成“--with-plumed=install”,这样toolchain会自动安装PLUMED(你就不需要事先安装了), 但toolchain安装的PLUMED (V2.6.2)不是最新版本,不能满足笔者的计算需求,所以笔者采用了事先安装好的PLUMED(V2.7.1)(后续笔者会跟大家分享PLUMED的安装及使用)。 这一步通常需要运行很...
这样就 OK 了,实现 CP2K 和 PLUMED 联动,也可以用 psmp: MPI+OpenMP混合并行,可以单机并行也可以跨节点并行。 另外,我之前没有安装 openMPI (因为我是在自己的主机上调试 CP2K,不是在服务器集群上安装),所以我的 PLUMED 是 non-MPI 版本。 PS:当时我用conda 安装的 PLUMED,作为 Miniconda 的忠实用户,安装...
cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=install --with-plumed=install时候,安装plumed...
nozomiTojo@lovelive:~/cp2k-9.1/tools/toolchain$./install_cp2k_toolchain.sh--math-mode=mkl--with-mkl=system--with-openblas=no--with-openmpi=install--with-gcc=system--with-scalapack=no--with-ptscotch=install--with-superlu=install--with-pexsi=install--with-quip=install--with-plumed=install ...
一步完成所有插件编译,没有任何报错。 plumed=installMPIis detected and it appears to be OpenMPI Compilingwith56processes.===FindingGCCfromsystem paths===path to gcc is/usr/bin/gcc path to g++is/usr/bin/g++path to gfortran is/usr/bin/gfortran Found include directory/usr/include Step gcc ...
./install_cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=install--with-plumed=install --...
三、toolchain安装各种库文件 推荐库文件: ./install_cp2k_toolchain.sh --math-mode=mkl --with-openmpi=install --with-scalapack=no --with-ptscotch=install --with-parmetis=install --with-metis=install --with-superlu=install --with-pexsi=install --with-quip=install --with-plumed=install ...
第三步:./install_cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=install --with-plumed=install --with-gcc=install。终端输入该命令,编译部署工具链。结束后显示y以下内容表示操作成功,并根据以下提示进行后续操作: === usage === Done! Now copy: cp /home/user/software/cp2k-2024.1/tools/toolch...
cp2k安装 # 下载链接 https://github.com/cp2k/cp2k/releases 注:tar.gz安装包make文件有问题$ tar -xf cp2k-2022.1.tar.bz2 $cdcp2k-2022.1/tools/toolchain $ ./install_cp2k_toolchain.sh -h 查看安装参数 $ ./install_cp2k_toolchain.sh --with-intel --with-intelmpi --with-plumed# 在脚本执...
3楼:Originally posted by浴雪飘零_at 2020-01-02 15:21:51 嘿毒瘤,安装好了么我可以帮你加微信吧...