3. BGISEQ RNA-Seq和ChIP-Seq探索IRF6如何调控下游转录 1)设计策略 为进一步探索IRF6影响肝脂肪变性的下游机制,研究者整合了高脂饮食的肝特异性IRF6敲除小鼠和对照小鼠的肝RNA-Seq数据、肝细胞中提取的IRF6染色质免疫共沉淀(ChIP)样品的ChIP-Seq数据,探寻候选目标,实验设计如图1。RNA-Seq 和 ChIP-Seq均由BGISEQ...
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Human/Mouse/Rat (48 Samples) 货号 20020596 规格 存储温度 产品详情 This component contains the RiboZero beads to deplete rRNA from Human, Mouse, Rat as well as the PCR master mix to transcript RNA into cDNA for 48 samples. 北京...
RNA IP-seq是研究细胞内 RNA 与蛋白结合情况的技术,以 RNA 免疫共沉淀(RIP)实验为基础,采用针对目标蛋白的特异性抗体把相应的 RNA 与蛋白质复合物沉淀出来,分离纯化复合物中的 RNA,通过 Illumina 测序,在全转录组范围内研究被目标蛋白特异性结合的 RNA 区域或种类,并比较样品/组间差异。 抗体类型丰富: 具有多...
诺禾致源使用 TruSeq RNA Exome Kit 推出 FFPE RNA-Seq 产品,专为检测 FFPE 样本设计,聚焦 RNA 的编码区,实现更加经济、高效的转录组分析。 产品参数 生信流程 数据表现 FFPE RNA-Seq,与 poly(A) RNA 测序相比,基因表达高度一致,且额外具有高数据产出率以及高 mRNA 比对率的优势。
TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set C (24 rxns) (Set C: indexes 25-36) 货号 RS-200-0036 规格 存储温度 产品详情 Kitted reagents for library preparation of 24 small RNA samples for multiplexed sequencing. Each kit contains indexes 25-36 of 48 unique indexes. 北京...
cpdong/IntronNeoantigen master 1Branch 0Tags Code README IntronNeoantigen A pipeline for calling intron retained derived neoantigens using RNA-Seq data These instructions will get you a copy of the project up and running on your local machine for development and testing purposes. See deployment ...
RNA-Seq获得差异表达基因,GO和KEGG分析发现和IRF6功能相关的生物学进程中,和对照小鼠比较,敲除小鼠过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)信号通路被高度富集(图2D)。ChIP-Seq获得的IRF6 在TSS±3000 bp范围内直接结合基因,与RNA-Seq差异表达基因结合分析,结果发现5个基因(图2F),其中PPARγ得分最高,PPARγ是调控...
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