5、绘制RCS曲线 (1)选择模型 可以根据数据与研究目的,选取合适的模型,有线性、logistic、Cox生存分析三种。(2)选择结局变量 结局变量必选,生存时间变量仅在Cox生存分析模型中会用到。(3)选择需要绘制RCS曲线的定量自变量 (4)选择“协变量”,控制混杂偏倚 这一步非必须,可以空白!结果就出来了!原始图像...
此模块可以指定分类变量中的参照组,只需要拖动参照组代表的方块放在第一位就可以了。 5、绘制RCS曲线 (1)选择模型 可以根据数据与研究目的,选取合适的模型,有线性、logistic、Cox生存分析三种。 (2)选择结局变量 结局变量必选,生存时间变量仅在Cox生存分析模型中会用到。 (3)选择需要绘制RCS曲线的定量自变量 (4)...
(1)选择模型可以根据数据与研究目的,选取合适的模型,有线性、logistic、Cox生存分析三种。 (2)选择结局变量 结局变量必选,生存时间变量仅在Cox生存分析模型中会用到。 (3)选择需要绘制RCS曲线的定量自变量 (4)选择“协变量”,控制混杂偏倚 这一步非必须,可以空白! 结果就出来了! 原始图像有点丑?没关系,可以个性...
方法:分析来自中国多机构登记和监测、流行病学和最终结果(SEER)数据库的I至III期切除RC(2008 - 2017)的数据,使用多变量模型确定ELN计数、分期迁移和总生存期(OS)之间的关系。使用LOWESS平滑法拟合阴性到阳性节点期迁移的比值比(ORs)和更多ELN的生存风险比(HR),并使用Chow检验确定结构断点。使用限制性立方样条(RCS)...
以下是绘制RCS曲线的一般步骤: 1.选择模型:根据数据和研究目的,选择合适的模型。在RCS曲线中,主要使用的是Cox生存分析模型。 2.选择结局变量:结局变量是必须选择的,通常为生存时间变量,这在Cox生存分析模型中会用到。 3.选择需要绘制RCS曲线的定量自变量:这些自变量可以是任何连续的定量变量,如年龄、体重指数等。 4...
RCS(Restricted CubicSplines)阈值效应是Cox回归中常用的一种建模技术,它允许我们对预测因素与事件发生率之间的关系进行非线性建模。通过将连续预测因素转化为非线性的曲线形式,RCS阈值效应可以更好地捕捉预测因素与事件发生率之间的复杂关系,使得模型更加准确。 本文将重点讨论Cox回归和RCS阈值效应的应用。首先,我们将介绍...
R语言|2.Cox模型:连续变量计算最佳阈值 高分SCI|1.生存分析之限制性立方样条(RCS) 接下来针对期刊杂志上的关于Cox+RCS的绘图思想,梳理一下杂志上的绘图方法,分享给大家。本文的主要采用基础绘图函数plot来完成。 2.文献图片分享 以下四张图均来自于读者提供的文献中图片,下图横坐标是某个连续研究指标,纵坐标是HR/...
样条主要有三种:自然样条,惩罚样条和限制性立方样条(restricted cubic splines,RCS)。本研究主要以限制性立方样条为例,采用限制性立方样条Cox比例风险回归模型分析体重指数(body mass index,BMI)与全因死亡风险的关系,以控制其他协变量对全因死亡风...
在这一步中,我们将拟合cox回归模型。 # 拟合cox回归模型cox_model<-coxph(surv_obj~X1+X2,data=data) 1. 2. 添加RCS交互作用 现在,我们将添加RCS交互作用。我们可以使用rms包中的rcs()函数来实现。 # 加载所需的包library(rms)# 添加RCS交互作用rcs_X1<-rcs(data$X1,3)rcs_X2<-rcs(data$X2,3)#...
建立模型 fit <- cph(Surv(time,status==1) ~ rcs(age,4), x=TRUE, y=TRUE,data=dt) 1. 绘图 ggrcs(data=dt,fit=fit,x="age") 1. RCS绘图好后我们想了解它的拐点,也就是阈值,因为函数刚写好,还没上下兼容,需要重新建一个一样的模型,但是不是rms包的cph函数,而是survival包的coxph函数。这就...