fpkm和count区别是：Counts是数据后台没有处理的原始表达量，而FPKM和是一种数据处理的方法。也就是说，如果下载Counts数据，是表达量数据，如果下载FPKM数据，那么要注意这些数据是经过处理的。正常情况下，我们下载Counts数据就可以了，特殊情况选择FPKM数据也是可以的。下载数据后，在数据分析时，用的方法也是
Read counts:校正后的 counts 值,对 counts 值进行负二项拟合和收缩后的数值;FPKM:在基因 counts 的基础上,对基因长度和总测序量进行了校正,用基因的 counts 值除以基因长度,再除以测序数据量(实际使用的是比对成功的 reads 总数),从而得到每个基因相对的表达水平。这个值更符合实际基因表达情况。欢迎点击图片进行...