首先它自己的主页即可,支持用户上传自己的基因列表,官网:http://cpdb.molgen.mpg.de/ 其次,它提供一个Cytoscape的插件, With the ConsensusPathDB plugin for Cytoscape you can mine evidence (publications, detection methods, pathways, etc.) for interactions loaded in Cytoscape and highlight interactions that...
1889-1907.Kamburov, A. et al. (2013) The ConsensusPathDB interaction database: 2013 update. Nucleic Acids Res.Kamburov, A. et al. (2011) ConsensusPathDB: toward a more complete picture of cell biology. Nucleic Acids Res.Kamburov, A. et al....
生物学功能基因集数据库之ConsensusPathDB 是否厌烦了GO和KEGG呢,试试看ConsensusPathDB吧,它的官网是:/ 有意思的是它对比了31个已有的 生物学功能基因集数据库,做了一个整理,算是集大成者?包括: 31个已有的 生物学功能基因集数据库 我简单看了看,就KEGG数据库我比较熟悉,作者自己说它这个数据集是这些其它...
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可以看到,我随意 挑选了两个基因集,居然就是简单的从KEGG数据库里面复制粘贴的?那么这个ConsensusPathDB的特殊价值,就是帮助我们筛选基因集吗? 如果你不会R代码也想使用这个数据库 首先它自己的主页即可,支持用户上传自己的基因列表,官网:http://cpdb.molgen./ ...
ConsensusPathDB—a database for integrating human functional interaction networks 文档格式: .pdf 文档大小: 2.16M 文档页数: 6页 顶/踩数: 0/0 收藏人数: 0 评论次数: 0 文档热度: 文档分类: 待分类 文档标签: ConsensusPathDBadatabaseforintegratinghumanfunctionalinteractionnetworks ...
ConsensusPathDB is a meta-database that integrates different types of functional interactions from heterogeneous interaction data resources. Physical protein interactions, metabolic and signaling reactions and gene regulatory interactions are integrated
Database resources and their functionalities: ConsensusPathDB and ToxDBGal BarelChristopher HardtAtanas KamburovRalf Herwig
ConsensusPathDB has grown mainly due to the integration of 12 further databases; it now contains 215 541 unique interactions and 4601 pathways from overall 30 databases. Binary protein interactions are scored with our confidence assessment tool, IntScore. The ConsensusPathDB web interface allows ...
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