可以time conda-unpack看一下。 $ Trinity #测试你打包的环境中软件能否调用 $ source deactivate #conda deactivate 是无法退出的。 这里需要注意的是最后环境的激活方式,是用source完成的。 迁移后环境名称为刚新建的文件夹test_env 如果迁移后的环境,一段时间经常用到,可以将source ~/test_env/bin/activate放入...
4、测试 [root@linuxprobe ~]# conda search trinity ## 没有之前的报错 Loading channels: done PackagesNotFoundError: The following packages are not availablefromcurrent channels:-trinity Current channels:- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/linux-64- https://mirrors.tuna.tsing...
无参组装:Trinity 查询软件是否可以用conda安装: 网站查询:https://anaconda.org/search $ conda search XXX 关键词搜索 fastaq conda 遇到conda安装问题: conda update -n base conda conda update --all 报错:Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve. 解决: conda ...
然后运行star-fusion流程需要需要下载配套数据库: nohup wget https://data.broadinstitute.org/Trinity/CTAT_RESOURCE_LIB/__genome_libs_StarFv1.10/GRCh38_gencode_v37_CTAT_lib_Mar012021.plug-n-play.tar.gz & # 这个文件有点大, # 32G 3月 6 2021 GRCh38_gencode_v37_CTAT_lib_Mar012021.plug-...
nohup wget https://data.broadinstitute.org/Trinity/CTAT_RESOURCE_LIB/__genome_libs_StarFv1.10/GRCh38_gencode_v37_CTAT_lib_Mar012021.plug-n-play.tar.gz 这个文件有点大, # 32G3月62021GRCh38_gencode_v37_CTAT_lib_Mar012021.plug-n-play.tar.gz ...
mamba search *python_abi* -c conda-forge mamba install -c conda-forge python_abi=2.7 mamba install -c bioconda star-fusion=1.9.0 gitclone--recursive https://github.com/STAR-Fusion/STAR-Fusion.git 但是我尝试了很多方法,都没办法成功安装独立的star-fusion-1.9.0软件 ,还是蛮奇怪的。 但是我git...