Sentieon为完整的纯软件基因变异检测二级分析方案,其分析流程完全忠于BWA、GATK、MuTect2、STAR、Minimap2、Fgbio、picard等金标准的数学模型。在匹配开源流程分析结果的前提下,大幅提升WGS、WES、Panel、UMI、ctDNA、RNA等测序数据的分析效率和检出精度,并匹配目前全部第二代、三代测序平台。 Sentieon软件团队拥有丰富的...
Sentieon为完整的纯软件基因变异检测二级分析方案,其分析流程完全忠于BWA、GATK、MuTect2、STAR、Minimap2、Fgbio、picard等金标准的数学模型。在匹配开源流程分析结果的前提下,大幅提升WGS、WES、Panel、UMI、ctDNA、RNA等测序数据的分析效率和检出精度,并匹配目前全部第二代、三代测序平台。 Sentieon软件团队拥有丰富的...
Sentieon为完整的纯软件基因变异检测二级分析方案,其分析流程完全忠于BWA、GATK、MuTect2、STAR、Minimap2、Fgbio、picard等金标准的数学模型。在匹配开源流程分析结果的前提下,大幅提升WGS、WES、Panel、UMI、ctDNA、RNA等测序数据的分析效率和检出精度,并匹配目前全部第二代、三代测序平台。 Sentieon软件团队拥有丰富的...
- git-#- bioconductor-biostrings=2.68.1 # from bioconda-#- flye # from bioconda-#- graphaligner=1.0.17 # from bioconda-#- mcl=22.282 # from bioconda-#- minimap2=2.26 # from bioconda-#- spoa=4.1.4 # from bioconda-#- trf=4.09.1 # from bioconda-#- r-pheatmap=1.0.12 # from bioco...
Sentieon为完整的纯软件基因变异检测二级分析方案,其分析流程完全忠于BWA、GATK、MuTect2、STAR、Minimap2、Fgbio、picard等金标准的数学模型。在匹配开源流程分析结果的前提下,大幅提升WGS、WES、Panel、UMI、ctDNA、RNA等测序数据的分析效率和检出精度,并匹配目前全部第二代、三代测序平台。
Sentieon为完整的纯软件基因变异检测二级分析方案,其分析流程完全忠于BWA、GATK、MuTect2、STAR、Minimap2、Fgbio、picard等金标准的数学模型。在匹配开源流程分析结果的前提下,大幅提升WGS、WES、Panel、UMI、ctDNA、RNA等测序数据的分析效率和检出精度,并匹配目前全部第二代、三代测序平台。
BSD-3-Clause-Clear license PacBio Secondary Analysis Tools on Bioconda Information PacBio® tools distributed viaBiocondaare: pre-release versions,not necessarily ISO compliant, intended for Research Use Only and not for use in diagnostic procedures, intended only for command-line users, and possibl...
Sentieon为完整的纯软件基因变异检测二级分析方案,其分析流程完全忠于BWA、GATK、MuTect2、STAR、Minimap2、Fgbio、picard等金标准的数学模型。在匹配开源流程分析结果的前提下,大幅提升WGS、WES、Panel、UMI、ctDNA、RNA等测序数据的分析效率和检出精度,并匹配目前全部第二代、三代测序平台。
不能直接执行“编写这个python get-pip.py。在这一切之后，运行python -m pip install --user opencv-...
这个时候,我们再使用2.4.1的时候,即使使用gmap也可以顺利跑通了 技术总结 # 1. 使用conda将pasa安装好 # 2. 进入pasa调用路径将PerLib的*.pm全部更改为可执行文件 # 3. 将/opt/pasa-2.4.1文件夹内容拷贝一份 # 4. 重新安装gmap版本 # 5. 将pasa-2.4.1备份拷贝回去原文件夹...