conda activate r_env 1. conda activate r_env将当前环境切换至r_env,以便我们可以在这个环境中运行命令。 3. 安装 RStudio Server 接下来,我们需要在环境中安装 RStudio Server: condainstall-cr rstudio-server 1. conda install用于安装软件包。 -c r指定使用 R 的 Conda 通道来查找包,而不是默认通道。
6. 修改设置Rstudio-server选择R版本 修改参数: vi /etc/rstudio/rserver.conf 1. 将下面代码放到里面: rsession-which-r=/mnt/data/R4.1_and_Rstudio/bin/R # 注意,这里是我们服务器上R4.1.0的路径 1. 重启Rstudio-server sudo rstudio-server status #查看RStudio-server sudo rstudio-server stop #...
使用服务器上面的Rstudioserve安装R包Seurat总是报错,无乱是使用install.packages还是BioManager和devtools,报错的原因总是非零,上网百度了很多还是没有办法解决,有的方法还需要管理员权限,比较麻烦。 于是换成conda安装R包,但是提示还是安装失败了,猜测主要原因可能是安装R包的环境比较杂,因为之前已经在这里面安装了一些...
sudo yum install rstudio-server-rhel-1.4.1717-x86_64.rpm ❝ 好吧,这是两行。 ❞ 6. 修改设置Rstudio-server选择R版本 修改参数: vi /etc/rstudio/rserver.conf 将下面代码放到里面: rsession-which-r=/mnt/data/R4.1_and_Rstudio/bin/R# 注意,这里是我们服务器上R4.1.0的路径 「重启Rstudio-...
sudo systemctl restart rstudio-server 4. 验证 R 版本 重新启动 RStudio Server 后,登录到 RStudio Server 界面,并在控制台中运行: sessionInfo() 这应该显示你的 R 版本为 4.1.3,表明你现在正在使用monocle3环境中的 R。 如果你按照你上步骤成功的在rstudio-server里面切换了,不同conda虚拟环境中的R。
sudo yum install rstudio-server-rhel-1.4.1717-x86_64.rpm ❝好吧,这是两行。 ❞ 6. 修改设置Rstudio-server选择R版本 修改参数: 代码语言:javascript 复制 vi/etc/rstudio/rserver.conf 将下面代码放到里面: 代码语言:javascript 复制 rsession-which-r=/mnt/data/R4.1_and_Rstudio/bin/R# 注意,这...
Running Rstudio Server with Singularity With this approach Rstudio Server runs in a Singularity container (based onrocker/rstudio). The conda environment gets mounted into the container - like that there's no need to rebuild the container to add a package andinstall.packagescan be used without...
使用Python的一定对著名的科学计算集成环境Anaconda（miniconda）并不陌生，而无论是使用Anaconda还是miniconda...
下载R的源代码,进行编译安装 wgethttps://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/src/base/R-3/R-3.6.1.tar.gz tar -zxvf R-3.6.1.tar.gz cd R-3.6.1 --enable-R-shlib for Rstudio server ./configure --enable-R-shlib make -j 8 make install ...
我用conda创建了两个虚拟环境:R4 和R41,分别用于运行4.0 和 4.1 的R。而且在各自对应的环境中,安装了相应版本的R包。 下图是vs code界面,我可以很方便的在多个版本间切换, 同时创建多个R控制台,极大提高了效率。(vs code可以通过ssh 连接服务器,所以我现在都很少用RStudio server了。)...